Protein–RNA interactions for Protein: O88273

Grem2, Gremlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grem2O88273 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Grem2O88273 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Grem2O88273 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Grem2O88273 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Grem2O88273 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Grem2O88273 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Grem2O88273 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Grem2O88273 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grem2O88273 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grem2O88273 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grem2O88273 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grem2O88273 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Grem2O88273 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grem2O88273 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grem2O88273 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grem2O88273 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grem2O88273 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grem2O88273 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Grem2O88273 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grem2O88273 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grem2O88273 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grem2O88273 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grem2O88273 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grem2O88273 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Grem2O88273 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grem2O88273 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grem2O88273 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grem2O88273 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grem2O88273 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grem2O88273 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grem2O88273 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grem2O88273 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grem2O88273 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Grem2O88273 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Grem2O88273 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grem2O88273 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grem2O88273 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grem2O88273 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grem2O88273 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grem2O88273 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grem2O88273 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grem2O88273 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grem2O88273 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grem2O88273 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grem2O88273 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grem2O88273 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Grem2O88273 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Grem2O88273 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Grem2O88273 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grem2O88273 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grem2O88273 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Grem2O88273 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grem2O88273 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grem2O88273 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grem2O88273 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Grem2O88273 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grem2O88273 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grem2O88273 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grem2O88273 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grem2O88273 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grem2O88273 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Grem2O88273 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Grem2O88273 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grem2O88273 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grem2O88273 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grem2O88273 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Grem2O88273 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grem2O88273 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Grem2O88273 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grem2O88273 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grem2O88273 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Grem2O88273 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grem2O88273 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grem2O88273 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grem2O88273 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grem2O88273 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Grem2O88273 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grem2O88273 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grem2O88273 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Grem2O88273 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Grem2O88273 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grem2O88273 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Grem2O88273 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Grem2O88273 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Grem2O88273 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grem2O88273 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Grem2O88273 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grem2O88273 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Grem2O88273 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Grem2O88273 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Grem2O88273 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grem2O88273 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grem2O88273 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Grem2O88273 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Grem2O88273 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Grem2O88273 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grem2O88273 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grem2O88273 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grem2O88273 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grem2O88273 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms