Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtssO70370 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtssO70370 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtssO70370 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CtssO70370 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtssO70370 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CtssO70370 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CtssO70370 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtssO70370 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtssO70370 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CtssO70370 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CtssO70370 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CtssO70370 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CtssO70370 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtssO70370 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CtssO70370 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtssO70370 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CtssO70370 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CtssO70370 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtssO70370 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtssO70370 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CtssO70370 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CtssO70370 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtssO70370 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CtssO70370 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CtssO70370 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtssO70370 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtssO70370 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CtssO70370 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtssO70370 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtssO70370 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtssO70370 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtssO70370 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtssO70370 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtssO70370 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtssO70370 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtssO70370 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtssO70370 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CtssO70370 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CtssO70370 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CtssO70370 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtssO70370 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtssO70370 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtssO70370 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtssO70370 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtssO70370 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtssO70370 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtssO70370 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtssO70370 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtssO70370 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtssO70370 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtssO70370 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CtssO70370 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtssO70370 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtssO70370 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtssO70370 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtssO70370 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtssO70370 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CtssO70370 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtssO70370 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CtssO70370 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtssO70370 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CtssO70370 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CtssO70370 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CtssO70370 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtssO70370 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtssO70370 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtssO70370 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtssO70370 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtssO70370 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtssO70370 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtssO70370 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtssO70370 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtssO70370 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtssO70370 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtssO70370 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtssO70370 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtssO70370 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtssO70370 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtssO70370 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtssO70370 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtssO70370 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CtssO70370 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtssO70370 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtssO70370 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtssO70370 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtssO70370 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtssO70370 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtssO70370 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtssO70370 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtssO70370 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtssO70370 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtssO70370 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtssO70370 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtssO70370 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtssO70370 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtssO70370 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtssO70370 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtssO70370 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtssO70370 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms