Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hmx1O70218 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hmx1O70218 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hmx1O70218 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hmx1O70218 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hmx1O70218 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hmx1O70218 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hmx1O70218 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hmx1O70218 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hmx1O70218 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hmx1O70218 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hmx1O70218 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hmx1O70218 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hmx1O70218 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hmx1O70218 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Hmx1O70218 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Hmx1O70218 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hmx1O70218 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hmx1O70218 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hmx1O70218 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hmx1O70218 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hmx1O70218 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hmx1O70218 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hmx1O70218 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hmx1O70218 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hmx1O70218 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hmx1O70218 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hmx1O70218 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Hmx1O70218 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hmx1O70218 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms