Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf13O54965 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf13O54965 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf13O54965 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf13O54965 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf13O54965 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf13O54965 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf13O54965 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf13O54965 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf13O54965 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf13O54965 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf13O54965 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf13O54965 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf13O54965 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf13O54965 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf13O54965 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf13O54965 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf13O54965 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf13O54965 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf13O54965 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf13O54965 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf13O54965 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf13O54965 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf13O54965 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf13O54965 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf13O54965 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf13O54965 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf13O54965 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf13O54965 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf13O54965 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf13O54965 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf13O54965 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf13O54965 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf13O54965 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf13O54965 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf13O54965 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf13O54965 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf13O54965 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf13O54965 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf13O54965 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf13O54965 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf13O54965 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf13O54965 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf13O54965 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf13O54965 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf13O54965 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf13O54965 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf13O54965 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf13O54965 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf13O54965 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf13O54965 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf13O54965 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf13O54965 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf13O54965 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf13O54965 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf13O54965 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf13O54965 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf13O54965 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf13O54965 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf13O54965 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf13O54965 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf13O54965 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf13O54965 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf13O54965 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms