Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rabep1O35551 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rabep1O35551 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rabep1O35551 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rabep1O35551 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rabep1O35551 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rabep1O35551 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rabep1O35551 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rabep1O35551 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rabep1O35551 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rabep1O35551 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rabep1O35551 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rabep1O35551 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rabep1O35551 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rabep1O35551 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rabep1O35551 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rabep1O35551 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rabep1O35551 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rabep1O35551 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rabep1O35551 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rabep1O35551 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rabep1O35551 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rabep1O35551 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rabep1O35551 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rabep1O35551 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rabep1O35551 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rabep1O35551 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rabep1O35551 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rabep1O35551 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rabep1O35551 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rabep1O35551 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rabep1O35551 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rabep1O35551 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rabep1O35551 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rabep1O35551 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rabep1O35551 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rabep1O35551 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rabep1O35551 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rabep1O35551 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rabep1O35551 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rabep1O35551 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Rabep1O35551 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rabep1O35551 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rabep1O35551 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rabep1O35551 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rabep1O35551 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rabep1O35551 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rabep1O35551 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rabep1O35551 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rabep1O35551 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rabep1O35551 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rabep1O35551 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rabep1O35551 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rabep1O35551 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rabep1O35551 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rabep1O35551 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rabep1O35551 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rabep1O35551 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rabep1O35551 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rabep1O35551 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
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