Protein–RNA interactions for Protein: L7N285

Gm3115, Predicted gene 3115, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3115L7N285 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3115L7N285 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3115L7N285 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3115L7N285 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3115L7N285 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3115L7N285 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3115L7N285 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3115L7N285 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3115L7N285 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3115L7N285 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm3115L7N285 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3115L7N285 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3115L7N285 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3115L7N285 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3115L7N285 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3115L7N285 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3115L7N285 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3115L7N285 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3115L7N285 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3115L7N285 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3115L7N285 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3115L7N285 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3115L7N285 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3115L7N285 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3115L7N285 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3115L7N285 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3115L7N285 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3115L7N285 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3115L7N285 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3115L7N285 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3115L7N285 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3115L7N285 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3115L7N285 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3115L7N285 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3115L7N285 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3115L7N285 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3115L7N285 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3115L7N285 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3115L7N285 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3115L7N285 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3115L7N285 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3115L7N285 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3115L7N285 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3115L7N285 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3115L7N285 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3115L7N285 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3115L7N285 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3115L7N285 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3115L7N285 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3115L7N285 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3115L7N285 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3115L7N285 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm3115L7N285 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3115L7N285 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3115L7N285 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3115L7N285 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3115L7N285 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3115L7N285 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms