Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm2056J3QQ02 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm2056J3QQ02 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm2056J3QQ02 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm2056J3QQ02 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm2056J3QQ02 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm2056J3QQ02 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm2056J3QQ02 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm2056J3QQ02 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm2056J3QQ02 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm2056J3QQ02 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm2056J3QQ02 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm2056J3QQ02 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2056J3QQ02 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2056J3QQ02 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2056J3QQ02 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm2056J3QQ02 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm2056J3QQ02 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm2056J3QQ02 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2056J3QQ02 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2056J3QQ02 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2056J3QQ02 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2056J3QQ02 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2056J3QQ02 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms