Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Arfgef1G3X9K3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Arfgef1G3X9K3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Arfgef1G3X9K3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Arfgef1G3X9K3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Arfgef1G3X9K3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Arfgef1G3X9K3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Arfgef1G3X9K3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Arfgef1G3X9K3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Arfgef1G3X9K3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Arfgef1G3X9K3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Arfgef1G3X9K3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Arfgef1G3X9K3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Arfgef1G3X9K3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Arfgef1G3X9K3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Arfgef1G3X9K3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Arfgef1G3X9K3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Arfgef1G3X9K3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Arfgef1G3X9K3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Arfgef1G3X9K3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Arfgef1G3X9K3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Arfgef1G3X9K3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Arfgef1G3X9K3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Arfgef1G3X9K3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Arfgef1G3X9K3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Arfgef1G3X9K3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Arfgef1G3X9K3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Arfgef1G3X9K3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Arfgef1G3X9K3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Arfgef1G3X9K3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Arfgef1G3X9K3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Arfgef1G3X9K3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Arfgef1G3X9K3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Arfgef1G3X9K3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Arfgef1G3X9K3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Arfgef1G3X9K3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Arfgef1G3X9K3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Arfgef1G3X9K3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Arfgef1G3X9K3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Arfgef1G3X9K3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Arfgef1G3X9K3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Arfgef1G3X9K3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Arfgef1G3X9K3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Arfgef1G3X9K3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Arfgef1G3X9K3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Arfgef1G3X9K3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Arfgef1G3X9K3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Arfgef1G3X9K3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Arfgef1G3X9K3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Arfgef1G3X9K3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Arfgef1G3X9K3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Arfgef1G3X9K3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Arfgef1G3X9K3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Arfgef1G3X9K3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Arfgef1G3X9K3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Arfgef1G3X9K3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Arfgef1G3X9K3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Arfgef1G3X9K3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Arfgef1G3X9K3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Arfgef1G3X9K3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Arfgef1G3X9K3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Arfgef1G3X9K3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Arfgef1G3X9K3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Arfgef1G3X9K3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Arfgef1G3X9K3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Arfgef1G3X9K3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms