Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Arid4aF8VPQ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Arid4aF8VPQ2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Arid4aF8VPQ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Arid4aF8VPQ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Arid4aF8VPQ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Arid4aF8VPQ2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Arid4aF8VPQ2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Arid4aF8VPQ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Arid4aF8VPQ2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Arid4aF8VPQ2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Arid4aF8VPQ2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Arid4aF8VPQ2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Arid4aF8VPQ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Arid4aF8VPQ2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Arid4aF8VPQ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Arid4aF8VPQ2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Arid4aF8VPQ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Arid4aF8VPQ2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Arid4aF8VPQ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Arid4aF8VPQ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Arid4aF8VPQ2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Arid4aF8VPQ2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Arid4aF8VPQ2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Arid4aF8VPQ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Arid4aF8VPQ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Arid4aF8VPQ2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Arid4aF8VPQ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Arid4aF8VPQ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Arid4aF8VPQ2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Arid4aF8VPQ2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Arid4aF8VPQ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Arid4aF8VPQ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Arid4aF8VPQ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Arid4aF8VPQ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Arid4aF8VPQ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Arid4aF8VPQ2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Arid4aF8VPQ2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Arid4aF8VPQ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Arid4aF8VPQ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Arid4aF8VPQ2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Arid4aF8VPQ2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Arid4aF8VPQ2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Arid4aF8VPQ2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Arid4aF8VPQ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Arid4aF8VPQ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Arid4aF8VPQ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Arid4aF8VPQ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Arid4aF8VPQ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Arid4aF8VPQ2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Arid4aF8VPQ2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Arid4aF8VPQ2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Arid4aF8VPQ2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Arid4aF8VPQ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Arid4aF8VPQ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Arid4aF8VPQ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Arid4aF8VPQ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Arid4aF8VPQ2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Arid4aF8VPQ2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Arid4aF8VPQ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Arid4aF8VPQ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Arid4aF8VPQ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Arid4aF8VPQ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Arid4aF8VPQ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Arid4aF8VPQ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Arid4aF8VPQ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Arid4aF8VPQ2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Arid4aF8VPQ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Arid4aF8VPQ2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Arid4aF8VPQ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Arid4aF8VPQ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Arid4aF8VPQ2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Arid4aF8VPQ2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Arid4aF8VPQ2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Arid4aF8VPQ2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Arid4aF8VPQ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Arid4aF8VPQ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Arid4aF8VPQ2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Arid4aF8VPQ2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Arid4aF8VPQ2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Arid4aF8VPQ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Arid4aF8VPQ2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Arid4aF8VPQ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Arid4aF8VPQ2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 332.7 ms