Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Erich3F6QRE9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Erich3F6QRE9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Erich3F6QRE9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Erich3F6QRE9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Erich3F6QRE9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Erich3F6QRE9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Erich3F6QRE9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Erich3F6QRE9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Erich3F6QRE9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Erich3F6QRE9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Erich3F6QRE9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Erich3F6QRE9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Erich3F6QRE9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Erich3F6QRE9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Erich3F6QRE9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Erich3F6QRE9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Erich3F6QRE9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Erich3F6QRE9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Erich3F6QRE9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Erich3F6QRE9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Erich3F6QRE9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Erich3F6QRE9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Erich3F6QRE9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Erich3F6QRE9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Erich3F6QRE9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Erich3F6QRE9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Erich3F6QRE9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Erich3F6QRE9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Erich3F6QRE9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Erich3F6QRE9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Erich3F6QRE9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Erich3F6QRE9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Erich3F6QRE9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Erich3F6QRE9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Erich3F6QRE9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Erich3F6QRE9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Erich3F6QRE9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Erich3F6QRE9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Erich3F6QRE9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Erich3F6QRE9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Erich3F6QRE9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Erich3F6QRE9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Erich3F6QRE9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Erich3F6QRE9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Erich3F6QRE9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Erich3F6QRE9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Erich3F6QRE9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Erich3F6QRE9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Erich3F6QRE9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Erich3F6QRE9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Erich3F6QRE9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Erich3F6QRE9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Erich3F6QRE9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Erich3F6QRE9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Erich3F6QRE9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Erich3F6QRE9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Erich3F6QRE9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Erich3F6QRE9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Erich3F6QRE9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Erich3F6QRE9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Erich3F6QRE9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Erich3F6QRE9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Erich3F6QRE9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Erich3F6QRE9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Erich3F6QRE9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Erich3F6QRE9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Erich3F6QRE9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Erich3F6QRE9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Erich3F6QRE9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Erich3F6QRE9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Erich3F6QRE9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Erich3F6QRE9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Erich3F6QRE9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Erich3F6QRE9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Erich3F6QRE9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Erich3F6QRE9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Erich3F6QRE9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Erich3F6QRE9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Erich3F6QRE9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Erich3F6QRE9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Erich3F6QRE9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Erich3F6QRE9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Erich3F6QRE9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Erich3F6QRE9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Erich3F6QRE9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Erich3F6QRE9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Erich3F6QRE9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Erich3F6QRE9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Erich3F6QRE9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Erich3F6QRE9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Erich3F6QRE9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Erich3F6QRE9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Erich3F6QRE9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Erich3F6QRE9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Erich3F6QRE9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Erich3F6QRE9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Erich3F6QRE9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Erich3F6QRE9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Erich3F6QRE9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms