Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

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Length 865 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pde8bE9Q4S1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pde8bE9Q4S1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Pde8bE9Q4S1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pde8bE9Q4S1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pde8bE9Q4S1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pde8bE9Q4S1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pde8bE9Q4S1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pde8bE9Q4S1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Pde8bE9Q4S1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pde8bE9Q4S1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pde8bE9Q4S1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Pde8bE9Q4S1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pde8bE9Q4S1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pde8bE9Q4S1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pde8bE9Q4S1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pde8bE9Q4S1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pde8bE9Q4S1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pde8bE9Q4S1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pde8bE9Q4S1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Pde8bE9Q4S1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pde8bE9Q4S1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pde8bE9Q4S1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pde8bE9Q4S1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pde8bE9Q4S1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pde8bE9Q4S1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pde8bE9Q4S1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pde8bE9Q4S1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pde8bE9Q4S1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pde8bE9Q4S1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pde8bE9Q4S1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pde8bE9Q4S1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pde8bE9Q4S1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pde8bE9Q4S1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pde8bE9Q4S1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pde8bE9Q4S1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pde8bE9Q4S1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pde8bE9Q4S1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pde8bE9Q4S1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pde8bE9Q4S1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pde8bE9Q4S1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Pde8bE9Q4S1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Pde8bE9Q4S1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pde8bE9Q4S1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pde8bE9Q4S1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pde8bE9Q4S1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pde8bE9Q4S1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pde8bE9Q4S1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pde8bE9Q4S1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pde8bE9Q4S1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pde8bE9Q4S1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pde8bE9Q4S1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pde8bE9Q4S1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pde8bE9Q4S1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Pde8bE9Q4S1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pde8bE9Q4S1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pde8bE9Q4S1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pde8bE9Q4S1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pde8bE9Q4S1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pde8bE9Q4S1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pde8bE9Q4S1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pde8bE9Q4S1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde8bE9Q4S1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde8bE9Q4S1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde8bE9Q4S1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde8bE9Q4S1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde8bE9Q4S1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pde8bE9Q4S1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pde8bE9Q4S1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pde8bE9Q4S1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pde8bE9Q4S1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pde8bE9Q4S1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pde8bE9Q4S1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Pde8bE9Q4S1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pde8bE9Q4S1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pde8bE9Q4S1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pde8bE9Q4S1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pde8bE9Q4S1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pde8bE9Q4S1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pde8bE9Q4S1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pde8bE9Q4S1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pde8bE9Q4S1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pde8bE9Q4S1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pde8bE9Q4S1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pde8bE9Q4S1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pde8bE9Q4S1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pde8bE9Q4S1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pde8bE9Q4S1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pde8bE9Q4S1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pde8bE9Q4S1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pde8bE9Q4S1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pde8bE9Q4S1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pde8bE9Q4S1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pde8bE9Q4S1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pde8bE9Q4S1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pde8bE9Q4S1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pde8bE9Q4S1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pde8bE9Q4S1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pde8bE9Q4S1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pde8bE9Q4S1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms