Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BC035044E0CXF8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BC035044E0CXF8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BC035044E0CXF8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BC035044E0CXF8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BC035044E0CXF8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BC035044E0CXF8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BC035044E0CXF8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BC035044E0CXF8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BC035044E0CXF8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BC035044E0CXF8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BC035044E0CXF8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BC035044E0CXF8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BC035044E0CXF8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC035044E0CXF8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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