Protein–RNA interactions for Protein: D3YTM9

Gm6569, Predicted gene 6569, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6569D3YTM9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6569D3YTM9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6569D3YTM9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6569D3YTM9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6569D3YTM9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6569D3YTM9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6569D3YTM9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6569D3YTM9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6569D3YTM9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6569D3YTM9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6569D3YTM9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6569D3YTM9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6569D3YTM9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6569D3YTM9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6569D3YTM9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6569D3YTM9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6569D3YTM9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6569D3YTM9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6569D3YTM9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6569D3YTM9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6569D3YTM9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6569D3YTM9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6569D3YTM9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6569D3YTM9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6569D3YTM9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6569D3YTM9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6569D3YTM9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6569D3YTM9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6569D3YTM9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6569D3YTM9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6569D3YTM9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6569D3YTM9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6569D3YTM9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm6569D3YTM9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6569D3YTM9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6569D3YTM9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm6569D3YTM9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm6569D3YTM9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm6569D3YTM9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm6569D3YTM9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm6569D3YTM9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms