Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf11cB4XVP9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phf11cB4XVP9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf11cB4XVP9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf11cB4XVP9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf11cB4XVP9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf11cB4XVP9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf11cB4XVP9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf11cB4XVP9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf11cB4XVP9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf11cB4XVP9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf11cB4XVP9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf11cB4XVP9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf11cB4XVP9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf11cB4XVP9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf11cB4XVP9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf11cB4XVP9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf11cB4XVP9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf11cB4XVP9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf11cB4XVP9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf11cB4XVP9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf11cB4XVP9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf11cB4XVP9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf11cB4XVP9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf11cB4XVP9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf11cB4XVP9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf11cB4XVP9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf11cB4XVP9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf11cB4XVP9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phf11cB4XVP9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phf11cB4XVP9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Phf11cB4XVP9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf11cB4XVP9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phf11cB4XVP9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phf11cB4XVP9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf11cB4XVP9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf11cB4XVP9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf11cB4XVP9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf11cB4XVP9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf11cB4XVP9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf11cB4XVP9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf11cB4XVP9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf11cB4XVP9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf11cB4XVP9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf11cB4XVP9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf11cB4XVP9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf11cB4XVP9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf11cB4XVP9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf11cB4XVP9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phf11cB4XVP9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf11cB4XVP9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf11cB4XVP9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf11cB4XVP9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Phf11cB4XVP9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phf11cB4XVP9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf11cB4XVP9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf11cB4XVP9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf11cB4XVP9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf11cB4XVP9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf11cB4XVP9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf11cB4XVP9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf11cB4XVP9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf11cB4XVP9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf11cB4XVP9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf11cB4XVP9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf11cB4XVP9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms