Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cfap58B2RW38 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cfap58B2RW38 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cfap58B2RW38 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cfap58B2RW38 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cfap58B2RW38 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cfap58B2RW38 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cfap58B2RW38 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cfap58B2RW38 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cfap58B2RW38 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cfap58B2RW38 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cfap58B2RW38 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cfap58B2RW38 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cfap58B2RW38 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cfap58B2RW38 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cfap58B2RW38 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cfap58B2RW38 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cfap58B2RW38 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cfap58B2RW38 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cfap58B2RW38 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cfap58B2RW38 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cfap58B2RW38 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cfap58B2RW38 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cfap58B2RW38 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cfap58B2RW38 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cfap58B2RW38 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cfap58B2RW38 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cfap58B2RW38 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cfap58B2RW38 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cfap58B2RW38 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cfap58B2RW38 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cfap58B2RW38 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cfap58B2RW38 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cfap58B2RW38 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cfap58B2RW38 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cfap58B2RW38 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cfap58B2RW38 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cfap58B2RW38 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cfap58B2RW38 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cfap58B2RW38 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cfap58B2RW38 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cfap58B2RW38 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cfap58B2RW38 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cfap58B2RW38 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cfap58B2RW38 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cfap58B2RW38 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cfap58B2RW38 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cfap58B2RW38 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cfap58B2RW38 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cfap58B2RW38 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cfap58B2RW38 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cfap58B2RW38 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cfap58B2RW38 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cfap58B2RW38 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cfap58B2RW38 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cfap58B2RW38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cfap58B2RW38 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cfap58B2RW38 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cfap58B2RW38 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cfap58B2RW38 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cfap58B2RW38 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms