Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfc3h1B2RT41 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfc3h1B2RT41 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfc3h1B2RT41 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfc3h1B2RT41 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfc3h1B2RT41 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfc3h1B2RT41 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfc3h1B2RT41 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfc3h1B2RT41 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfc3h1B2RT41 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfc3h1B2RT41 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfc3h1B2RT41 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfc3h1B2RT41 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfc3h1B2RT41 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfc3h1B2RT41 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zfc3h1B2RT41 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfc3h1B2RT41 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfc3h1B2RT41 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfc3h1B2RT41 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfc3h1B2RT41 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfc3h1B2RT41 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfc3h1B2RT41 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfc3h1B2RT41 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfc3h1B2RT41 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfc3h1B2RT41 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfc3h1B2RT41 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfc3h1B2RT41 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfc3h1B2RT41 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfc3h1B2RT41 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Zfc3h1B2RT41 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfc3h1B2RT41 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfc3h1B2RT41 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Zfc3h1B2RT41 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfc3h1B2RT41 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfc3h1B2RT41 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfc3h1B2RT41 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfc3h1B2RT41 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfc3h1B2RT41 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfc3h1B2RT41 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfc3h1B2RT41 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfc3h1B2RT41 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfc3h1B2RT41 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfc3h1B2RT41 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfc3h1B2RT41 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfc3h1B2RT41 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfc3h1B2RT41 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfc3h1B2RT41 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfc3h1B2RT41 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfc3h1B2RT41 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfc3h1B2RT41 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfc3h1B2RT41 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfc3h1B2RT41 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfc3h1B2RT41 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfc3h1B2RT41 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfc3h1B2RT41 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms