Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssxb8B1AY40 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssxb8B1AY40 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssxb8B1AY40 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssxb8B1AY40 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssxb8B1AY40 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ssxb8B1AY40 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssxb8B1AY40 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ssxb8B1AY40 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ssxb8B1AY40 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssxb8B1AY40 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssxb8B1AY40 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ssxb8B1AY40 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssxb8B1AY40 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssxb8B1AY40 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ssxb8B1AY40 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ssxb8B1AY40 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssxb8B1AY40 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssxb8B1AY40 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssxb8B1AY40 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssxb8B1AY40 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssxb8B1AY40 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssxb8B1AY40 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssxb8B1AY40 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssxb8B1AY40 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssxb8B1AY40 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssxb8B1AY40 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssxb8B1AY40 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssxb8B1AY40 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssxb8B1AY40 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssxb8B1AY40 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssxb8B1AY40 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssxb8B1AY40 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssxb8B1AY40 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
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