Protein–RNA interactions for Protein: B1AX85

6030498E09Rik, RIKEN cDNA 6030498E09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030498E09RikB1AX85 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
6030498E09RikB1AX85 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
6030498E09RikB1AX85 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
6030498E09RikB1AX85 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
6030498E09RikB1AX85 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
6030498E09RikB1AX85 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
6030498E09RikB1AX85 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
6030498E09RikB1AX85 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
6030498E09RikB1AX85 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
6030498E09RikB1AX85 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
6030498E09RikB1AX85 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
6030498E09RikB1AX85 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
6030498E09RikB1AX85 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
6030498E09RikB1AX85 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
6030498E09RikB1AX85 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
6030498E09RikB1AX85 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
6030498E09RikB1AX85 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
6030498E09RikB1AX85 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
6030498E09RikB1AX85 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
6030498E09RikB1AX85 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
6030498E09RikB1AX85 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
6030498E09RikB1AX85 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
6030498E09RikB1AX85 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
6030498E09RikB1AX85 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
6030498E09RikB1AX85 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
6030498E09RikB1AX85 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
6030498E09RikB1AX85 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
6030498E09RikB1AX85 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
6030498E09RikB1AX85 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
6030498E09RikB1AX85 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
6030498E09RikB1AX85 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
6030498E09RikB1AX85 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
6030498E09RikB1AX85 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
6030498E09RikB1AX85 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
6030498E09RikB1AX85 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
6030498E09RikB1AX85 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
6030498E09RikB1AX85 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
6030498E09RikB1AX85 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
6030498E09RikB1AX85 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
6030498E09RikB1AX85 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
6030498E09RikB1AX85 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
6030498E09RikB1AX85 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
6030498E09RikB1AX85 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
6030498E09RikB1AX85 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
6030498E09RikB1AX85 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
6030498E09RikB1AX85 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms