Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp2c2A7L9Z8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2c2A7L9Z8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp2c2A7L9Z8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2c2A7L9Z8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2c2A7L9Z8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2c2A7L9Z8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp2c2A7L9Z8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp2c2A7L9Z8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp2c2A7L9Z8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Atp2c2A7L9Z8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2c2A7L9Z8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp2c2A7L9Z8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2c2A7L9Z8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2c2A7L9Z8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2c2A7L9Z8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2c2A7L9Z8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2c2A7L9Z8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp2c2A7L9Z8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2c2A7L9Z8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2c2A7L9Z8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp2c2A7L9Z8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2c2A7L9Z8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2c2A7L9Z8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms