Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Palm3A2TJV2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Palm3A2TJV2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Palm3A2TJV2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Palm3A2TJV2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Palm3A2TJV2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Palm3A2TJV2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Palm3A2TJV2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Palm3A2TJV2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Palm3A2TJV2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Palm3A2TJV2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Palm3A2TJV2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Palm3A2TJV2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Palm3A2TJV2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Palm3A2TJV2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Palm3A2TJV2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Palm3A2TJV2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Palm3A2TJV2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Palm3A2TJV2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Palm3A2TJV2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Palm3A2TJV2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Palm3A2TJV2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Palm3A2TJV2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Palm3A2TJV2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Palm3A2TJV2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Palm3A2TJV2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Palm3A2TJV2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Palm3A2TJV2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Palm3A2TJV2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Palm3A2TJV2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Palm3A2TJV2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Palm3A2TJV2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Palm3A2TJV2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Palm3A2TJV2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Palm3A2TJV2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Palm3A2TJV2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Palm3A2TJV2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Palm3A2TJV2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Palm3A2TJV2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Palm3A2TJV2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Palm3A2TJV2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Palm3A2TJV2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Palm3A2TJV2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Palm3A2TJV2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Palm3A2TJV2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Palm3A2TJV2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Palm3A2TJV2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Palm3A2TJV2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Palm3A2TJV2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Palm3A2TJV2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Palm3A2TJV2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Palm3A2TJV2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Palm3A2TJV2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Palm3A2TJV2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Palm3A2TJV2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Palm3A2TJV2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Palm3A2TJV2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Palm3A2TJV2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Palm3A2TJV2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Palm3A2TJV2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Palm3A2TJV2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Palm3A2TJV2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Palm3A2TJV2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Palm3A2TJV2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Palm3A2TJV2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Palm3A2TJV2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Palm3A2TJV2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Palm3A2TJV2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Palm3A2TJV2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Palm3A2TJV2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Palm3A2TJV2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Palm3A2TJV2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Palm3A2TJV2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Palm3A2TJV2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Palm3A2TJV2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Palm3A2TJV2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Palm3A2TJV2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Palm3A2TJV2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Palm3A2TJV2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Palm3A2TJV2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Palm3A2TJV2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Palm3A2TJV2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Palm3A2TJV2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Palm3A2TJV2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms