Protein–RNA interactions for Protein: A2A4F1

Rhox7a, Reproductive homeobox 7A, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox7aA2A4F1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhox7aA2A4F1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rhox7aA2A4F1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rhox7aA2A4F1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rhox7aA2A4F1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rhox7aA2A4F1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhox7aA2A4F1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhox7aA2A4F1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rhox7aA2A4F1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rhox7aA2A4F1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rhox7aA2A4F1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rhox7aA2A4F1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhox7aA2A4F1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rhox7aA2A4F1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rhox7aA2A4F1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rhox7aA2A4F1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rhox7aA2A4F1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rhox7aA2A4F1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rhox7aA2A4F1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rhox7aA2A4F1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rhox7aA2A4F1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rhox7aA2A4F1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rhox7aA2A4F1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rhox7aA2A4F1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rhox7aA2A4F1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rhox7aA2A4F1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rhox7aA2A4F1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhox7aA2A4F1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rhox7aA2A4F1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhox7aA2A4F1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhox7aA2A4F1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhox7aA2A4F1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhox7aA2A4F1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhox7aA2A4F1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rhox7aA2A4F1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox7aA2A4F1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox7aA2A4F1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox7aA2A4F1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhox7aA2A4F1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms