Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YCZ6

1700016G14Rik, RIKEN cDNA 1700016G14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
1700016G14RikA0A286YCZ6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
1700016G14RikA0A286YCZ6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700016G14RikA0A286YCZ6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700016G14RikA0A286YCZ6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
1700016G14RikA0A286YCZ6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
1700016G14RikA0A286YCZ6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
1700016G14RikA0A286YCZ6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
1700016G14RikA0A286YCZ6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
1700016G14RikA0A286YCZ6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
1700016G14RikA0A286YCZ6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1700016G14RikA0A286YCZ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
1700016G14RikA0A286YCZ6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
1700016G14RikA0A286YCZ6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
1700016G14RikA0A286YCZ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
1700016G14RikA0A286YCZ6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
1700016G14RikA0A286YCZ6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
1700016G14RikA0A286YCZ6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
1700016G14RikA0A286YCZ6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
1700016G14RikA0A286YCZ6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
1700016G14RikA0A286YCZ6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
1700016G14RikA0A286YCZ6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
1700016G14RikA0A286YCZ6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
1700016G14RikA0A286YCZ6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
1700016G14RikA0A286YCZ6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms