Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms