Protein–RNA interactions for Protein: P32329

YPS1, Aspartic proteinase 3, yeastyeast

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPS1P32329 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YPS1P32329 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
YPS1P32329 ULI1YFR026C 510 nt0.58□□□□□ -2.32
YPS1P32329 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.58□□□□□ -2.32
YPS1P32329 PAU12YGR294W 363 nt0.58□□□□□ -2.32
YPS1P32329 APQ12YIL040W 417 nt0.58□□□□□ -2.32
YPS1P32329 YLR282CYLR282C 342 nt0.57□□□□□ -2.32
YPS1P32329 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.57□□□□□ -2.32
YPS1P32329 snR190snR190 190 nt0.57□□□□□ -2.32
YPS1P32329 UTP20YBL004W 7482 nt0.56□□□□□ -2.32
YPS1P32329 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.56□□□□□ -2.32
YPS1P32329 BLI1YKL061W 342 nt0.56□□□□□ -2.32
YPS1P32329 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.55□□□□□ -2.32
YPS1P32329 YML002WYML002W 2214 nt0.54□□□□□ -2.32
YPS1P32329 MYO1YHR023W 5787 nt0.54□□□□□ -2.32
YPS1P32329 SEC8YPR055W 3198 nt0.53□□□□□ -2.32
YPS1P32329 YEL014CYEL014C 306 nt0.53□□□□□ -2.32
YPS1P32329 QCR9YGR183C 201 nt0.53□□□□□ -2.32
YPS1P32329 COX5BYIL111W 456 nt0.53□□□□□ -2.32
YPS1P32329 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.53□□□□□ -2.32
YPS1P32329 BEM3YPL115C 3387 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 snR52snR52 92 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 FYV10YIL097W 1551 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 YMR160WYMR160W 2451 nt0.52□□□□□ -2.33
YPS1P32329 HAL9YOL089C 3093 nt0.51□□□□□ -2.33
YPS1P32329 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.51□□□□□ -2.33
YPS1P32329 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.51□□□□□ -2.33
YPS1P32329 YJL182CYJL182C 318 nt0.51□□□□□ -2.33
YPS1P32329 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.51□□□□□ -2.33
YPS1P32329 UTP10YJL109C 5310 nt0.5□□□□□ -2.33
YPS1P32329 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.49□□□□□ -2.33
YPS1P32329 YLR041WYLR041W 321 nt0.49□□□□□ -2.33
YPS1P32329 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.49□□□□□ -2.33
YPS1P32329 PRP5YBR237W 2550 nt0.48□□□□□ -2.33
YPS1P32329 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.48□□□□□ -2.33
YPS1P32329 YJL150WYJL150W 303 nt0.48□□□□□ -2.33
YPS1P32329 YOL014WYOL014W 375 nt0.48□□□□□ -2.33
YPS1P32329 snR46snR46 197 nt0.48□□□□□ -2.33
YPS1P32329 PRP42YDR235W 1635 nt0.48□□□□□ -2.33
YPS1P32329 UTP8YGR128C 2142 nt0.47□□□□□ -2.33
YPS1P32329 YNL198CYNL198C 303 nt0.47□□□□□ -2.33
YPS1P32329 MLP1YKR095W 5628 nt0.47□□□□□ -2.33
YPS1P32329 PRP39YML046W 1890 nt0.47□□□□□ -2.33
YPS1P32329 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.46□□□□□ -2.34
YPS1P32329 OST4YDL232W 111 nt0.45□□□□□ -2.34
YPS1P32329 YSP1YHR155W 3687 nt0.44□□□□□ -2.34
YPS1P32329 TRS65YGR166W 1683 nt0.44□□□□□ -2.34
YPS1P32329 TAH1YCR060W 336 nt0.44□□□□□ -2.34
YPS1P32329 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.44□□□□□ -2.34
YPS1P32329 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.44□□□□□ -2.34
YPS1P32329 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.43□□□□□ -2.34
YPS1P32329 PET111YMR257C 2403 nt0.43□□□□□ -2.34
YPS1P32329 SNU13YEL026W 381 nt0.43□□□□□ -2.34
YPS1P32329 YEL073CYEL073C 324 nt0.43□□□□□ -2.34
YPS1P32329 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.43□□□□□ -2.34
YPS1P32329 IQG1YPL242C 4488 nt0.43□□□□□ -2.34
YPS1P32329 YDR544CYDR544C 429 nt0.42□□□□□ -2.34
YPS1P32329 YGL182CYGL182C 324 nt0.42□□□□□ -2.34
YPS1P32329 YLR232WYLR232W 348 nt0.42□□□□□ -2.34
YPS1P32329 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.42□□□□□ -2.34
YPS1P32329 YNL337WYNL337W 255 nt0.41□□□□□ -2.34
YPS1P32329 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.4□□□□□ -2.35
YPS1P32329 SBH1YER087C-B 249 nt0.39□□□□□ -2.35
YPS1P32329 MLP2YIL149C 5040 nt0.38□□□□□ -2.35
YPS1P32329 NNF2YGR089W 2811 nt0.37□□□□□ -2.35
YPS1P32329 YGR151CYGR151C 336 nt0.37□□□□□ -2.35
YPS1P32329 BIR1YJR089W 2865 nt0.36□□□□□ -2.35
YPS1P32329 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.36□□□□□ -2.35
YPS1P32329 AI1Q0050 2505 nt0.35□□□□□ -2.35
YPS1P32329 SDH6YDR379C-A 240 nt0.35□□□□□ -2.35
YPS1P32329 YBL053WYBL053W 375 nt0.35□□□□□ -2.35
YPS1P32329 YNL338WYNL338W 159 nt0.35□□□□□ -2.35
YPS1P32329 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.35□□□□□ -2.35
YPS1P32329 ULP2YIL031W 3105 nt0.34□□□□□ -2.35
YPS1P32329 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.34□□□□□ -2.36
YPS1P32329 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.34□□□□□ -2.36
YPS1P32329 YOR170WYOR170W 306 nt0.34□□□□□ -2.36
YPS1P32329 COG6YNL041C 2520 nt0.34□□□□□ -2.36
YPS1P32329 FMP27YLR454W 7887 nt0.33□□□□□ -2.36
YPS1P32329 RPS26AYGL189C 360 nt0.33□□□□□ -2.36
YPS1P32329 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.33□□□□□ -2.36
YPS1P32329 ORC3YLL004W 1851 nt0.33□□□□□ -2.36
YPS1P32329 NIP1YMR309C 2439 nt0.32□□□□□ -2.36
YPS1P32329 YOR102WYOR102W 351 nt0.32□□□□□ -2.36
YPS1P32329 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.32□□□□□ -2.36
YPS1P32329 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.31□□□□□ -2.36
YPS1P32329 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt0.31□□□□□ -2.36
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