Protein–RNA interactions for Protein: Q12420

SNU66, 66 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU66Q12420 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.09□□□□□ -2.23
SNU66Q12420 HMRA2YCR096C 360 nt1.08□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.08□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.08□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.08□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.08□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.08□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 YGR069WYGR069W 336 nt1.08□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 RAD61YDR014W 1944 nt1.08□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 PTP2YOR208W 2253 nt1.07□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 PAU12YGR294W 363 nt1.07□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 YHL042WYHL042W 453 nt1.07□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 CSE2YNR010W 450 nt1.07□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 YOR015WYOR015W 360 nt1.07□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.07□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 PAU24YBR301W 363 nt1.07□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 snR65snR65 100 nt1.06□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 UTP20YBL004W 7482 nt1.05□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 WAR1YML076C 2835 nt1.04□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 RPS27BYHR021C 249 nt1.04□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 SGF11YPL047W 300 nt1.04□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 DOP1YDR141C 5097 nt1.04□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 MCM10YIL150C 1716 nt1.03□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.03□□□□□ -2.24
SNU66Q12420 YMR321CYMR321C 318 nt1.02□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 YNL028WYNL028W 318 nt1.02□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 YOR218CYOR218C 420 nt1.01□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 ISD11YER048W-A 285 nt1□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 YER181CYER181C 324 nt1□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 OLI1Q0130 231 nt1□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 IES4YOR189W 351 nt1□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.99□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 MYO1YHR023W 5787 nt0.98□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.98□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.98□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.98□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.98□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.98□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.98□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.98□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.98□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 YNL211CYNL211C 261 nt0.98□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 SMC1YFL008W 3678 nt0.97□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.97□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 YGL052WYGL052W 306 nt0.97□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.97□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.97□□□□□ -2.25
SNU66Q12420 snR74snR74 88 nt0.96□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 QCR9YGR183C 201 nt0.96□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.96□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 YOR282WYOR282W 321 nt0.96□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.95□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 CMC4YMR194C-B 222 nt0.95□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.95□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 YPR092WYPR092W 306 nt0.95□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 RKR1YMR247C 4689 nt0.94□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.94□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.94□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 YDL196WYDL196W 330 nt0.93□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 YGL041CYGL041C 204 nt0.93□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 LTE1YAL024C 4308 nt0.93□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 BFR2YDR299W 1605 nt0.92□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 NOP9YJL010C 2001 nt0.91□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 ASE1YOR058C 2658 nt0.91□□□□□ -2.26
SNU66Q12420 YMR160WYMR160W 2451 nt0.9□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 YCR022CYCR022C 345 nt0.9□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 YDL073WYDL073W 2955 nt0.89□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.89□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.88□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.87□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 YPL044CYPL044C 549 nt0.87□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 snR49snR49 165 nt0.87□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 SEC1YDR164C 2175 nt0.86□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.86□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.86□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.86□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.86□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.86□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.86□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.86□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.86□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.86□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.86□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.86□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.86□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.86□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.85□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 PAA1YDR071C 576 nt0.84□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.84□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.84□□□□□ -2.27
SNU66Q12420 NPR2YEL062W 1848 nt0.84□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 snR55snR55 98 nt0.83□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 snR80snR80 171 nt0.83□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 COY1YKL179C 2040 nt0.82□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.82□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 PMP1YCR024C-A 123 nt0.8□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.8□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 RPL26BYGR034W 384 nt0.8□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.8□□□□□ -2.28
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