Protein–RNA interactions for Protein: Q12298

YDR061W, Uncharacterized ABC transporter ATP-binding protein YDR061W, yeastyeast

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDR061WQ12298 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 YJR029WYJR029W 5268 nt1.04□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.04□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 PTP2YOR208W 2253 nt1.04□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 DOP1YDR141C 5097 nt1.03□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 YDL206WYDL206W 2289 nt1.03□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 HMRA2YCR096C 360 nt1.03□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 GPG1YGL121C 381 nt1.03□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.03□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.03□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.03□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.03□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.03□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 CSE2YNR010W 450 nt1.03□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 YOR282WYOR282W 321 nt1.03□□□□□ -2.24
YDR061WQ12298 YNL028WYNL028W 318 nt1.02□□□□□ -2.25
YDR061WQ12298 RPS25BYLR333C 327 nt1.01□□□□□ -2.25
YDR061WQ12298 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.01□□□□□ -2.25
YDR061WQ12298 BEM2YER155C 6504 nt0.99□□□□□ -2.25
YDR061WQ12298 YDR521WYDR521W 336 nt0.99□□□□□ -2.25
YDR061WQ12298 RPS27BYHR021C 249 nt0.99□□□□□ -2.25
YDR061WQ12298 YJL120WYJL120W 324 nt0.99□□□□□ -2.25
YDR061WQ12298 YMR321CYMR321C 318 nt0.99□□□□□ -2.25
YDR061WQ12298 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt0.99□□□□□ -2.25
YDR061WQ12298 SPO21YOL091W 1830 nt0.99□□□□□ -2.25
YDR061WQ12298 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.98□□□□□ -2.25
YDR061WQ12298 YOR218CYOR218C 420 nt0.98□□□□□ -2.25
YDR061WQ12298 YBR206WYBR206W 324 nt0.98□□□□□ -2.25
YDR061WQ12298 WAR1YML076C 2835 nt0.97□□□□□ -2.25
YDR061WQ12298 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.97□□□□□ -2.25
YDR061WQ12298 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.97□□□□□ -2.25
YDR061WQ12298 IES4YOR189W 351 nt0.96□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 YBR064WYBR064W 429 nt0.96□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 SCC2YDR180W 4482 nt0.95□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 YDL196WYDL196W 330 nt0.95□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 YGL052WYGL052W 306 nt0.95□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.95□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.95□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.95□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.95□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 YOR015WYOR015W 360 nt0.95□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 SMC1YFL008W 3678 nt0.94□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 snR49snR49 165 nt0.94□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 MCM10YIL150C 1716 nt0.94□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 snR8snR8 190 nt0.93□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 ECM12YHR021W-A 456 nt0.93□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 YDR366CYDR366C 399 nt0.92□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 ISD11YER048W-A 285 nt0.92□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.92□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 YPR092WYPR092W 306 nt0.92□□□□□ -2.26
YDR061WQ12298 snR55snR55 98 nt0.9□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 YGL041CYGL041C 204 nt0.9□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.9□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.9□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 SGF11YPL047W 300 nt0.9□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 GEA2YEL022W 4380 nt0.89□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 YMR160WYMR160W 2451 nt0.89□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 snR74snR74 88 nt0.87□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 OLI1Q0130 231 nt0.87□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 ABF2YMR072W 552 nt0.87□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt0.86□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.86□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 BIR1YJR089W 2865 nt0.86□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 snR80snR80 171 nt0.85□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.85□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.85□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 YOL014WYOL014W 375 nt0.85□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt0.84□□□□□ -2.27
YDR061WQ12298 NOP9YJL010C 2001 nt0.83□□□□□ -2.28
YDR061WQ12298 PMP1YCR024C-A 123 nt0.83□□□□□ -2.28
YDR061WQ12298 CMC4YMR194C-B 222 nt0.83□□□□□ -2.28
YDR061WQ12298 YNL211CYNL211C 261 nt0.83□□□□□ -2.28
YDR061WQ12298 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.82□□□□□ -2.28
YDR061WQ12298 NPR2YEL062W 1848 nt0.81□□□□□ -2.28
YDR061WQ12298 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.81□□□□□ -2.28
YDR061WQ12298 YKU70YMR284W 1809 nt0.8□□□□□ -2.28
YDR061WQ12298 BFR2YDR299W 1605 nt0.8□□□□□ -2.28
YDR061WQ12298 PAA1YDR071C 576 nt0.8□□□□□ -2.28
YDR061WQ12298 RKR1YMR247C 4689 nt0.8□□□□□ -2.28
YDR061WQ12298 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.79□□□□□ -2.28
YDR061WQ12298 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.79□□□□□ -2.28
YDR061WQ12298 YPL044CYPL044C 549 nt0.79□□□□□ -2.28
YDR061WQ12298 ASE1YOR058C 2658 nt0.78□□□□□ -2.28
YDR061WQ12298 YOR302WYOR302W 78 nt0.78□□□□□ -2.28
YDR061WQ12298 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.75□□□□□ -2.29
YDR061WQ12298 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.75□□□□□ -2.29
YDR061WQ12298 RPL26BYGR034W 384 nt0.75□□□□□ -2.29
YDR061WQ12298 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.75□□□□□ -2.29
YDR061WQ12298 COY1YKL179C 2040 nt0.74□□□□□ -2.29
YDR061WQ12298 SPG3YDR504C 384 nt0.74□□□□□ -2.29
YDR061WQ12298 ULI1YFR026C 510 nt0.74□□□□□ -2.29
YDR061WQ12298 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.74□□□□□ -2.29
YDR061WQ12298 YOR345CYOR345C 351 nt0.74□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.3 ms