Protein–RNA interactions for Protein: Q12242

RUP1, UBA domain-containing protein RUP1, yeastyeast

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUP1Q12242 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.89□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 YKL118WYKL118W 312 nt0.89□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 CMC4YMR194C-B 222 nt0.89□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 YNL211CYNL211C 261 nt0.89□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 SCC2YDR180W 4482 nt0.89□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 YER097WYER097W 330 nt0.88□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 IES4YOR189W 351 nt0.88□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 YDL073WYDL073W 2955 nt0.87□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt0.87□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 ISD11YER048W-A 285 nt0.87□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.87□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 PAU24YBR301W 363 nt0.87□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 NOP9YJL010C 2001 nt0.87□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 VIK1YPL253C 1944 nt0.87□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 ASE1YOR058C 2658 nt0.86□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 YMR321CYMR321C 318 nt0.86□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 YGL149WYGL149W 306 nt0.85□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 RPS27BYHR021C 249 nt0.85□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 YPL044CYPL044C 549 nt0.85□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 YKL136WYKL136W 399 nt0.84□□□□□ -2.27
RUP1Q12242 UBP3YER151C 2739 nt0.83□□□□□ -2.28
RUP1Q12242 MYO1YHR023W 5787 nt0.82□□□□□ -2.28
RUP1Q12242 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.82□□□□□ -2.28
RUP1Q12242 PAM16YJL104W 450 nt0.82□□□□□ -2.28
RUP1Q12242 YOR282WYOR282W 321 nt0.82□□□□□ -2.28
RUP1Q12242 PMP1YCR024C-A 123 nt0.81□□□□□ -2.28
RUP1Q12242 CSE2YNR010W 450 nt0.81□□□□□ -2.28
RUP1Q12242 YOR218CYOR218C 420 nt0.81□□□□□ -2.28
RUP1Q12242 STE5YDR103W 2754 nt0.81□□□□□ -2.28
RUP1Q12242 YOR015WYOR015W 360 nt0.8□□□□□ -2.28
RUP1Q12242 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.79□□□□□ -2.28
RUP1Q12242 SEC1YDR164C 2175 nt0.79□□□□□ -2.28
RUP1Q12242 PAA1YDR071C 576 nt0.78□□□□□ -2.28
RUP1Q12242 CHS6YJL099W 2241 nt0.76□□□□□ -2.29
RUP1Q12242 NPR2YEL062W 1848 nt0.75□□□□□ -2.29
RUP1Q12242 RPL26BYGR034W 384 nt0.75□□□□□ -2.29
RUP1Q12242 RPL39YJL189W 156 nt0.75□□□□□ -2.29
RUP1Q12242 YNL028WYNL028W 318 nt0.75□□□□□ -2.29
RUP1Q12242 RAD61YDR014W 1944 nt0.75□□□□□ -2.29
RUP1Q12242 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.74□□□□□ -2.29
RUP1Q12242 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.74□□□□□ -2.29
RUP1Q12242 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.73□□□□□ -2.29
RUP1Q12242 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.73□□□□□ -2.29
RUP1Q12242 RPS30BYOR182C 192 nt0.73□□□□□ -2.29
RUP1Q12242 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.73□□□□□ -2.29
RUP1Q12242 LTE1YAL024C 4308 nt0.73□□□□□ -2.29
RUP1Q12242 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.72□□□□□ -2.29
RUP1Q12242 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.72□□□□□ -2.29
RUP1Q12242 PRP16YKR086W 3216 nt0.71□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 YML002WYML002W 2214 nt0.71□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.71□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 Q0142Q0142 177 nt0.7□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 YGR069WYGR069W 336 nt0.7□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.7□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.69□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.69□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 snR190snR190 190 nt0.69□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 COY1YKL179C 2040 nt0.68□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.68□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 FYV10YIL097W 1551 nt0.67□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 snR74snR74 88 nt0.67□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.67□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.67□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 UTP10YJL109C 5310 nt0.67□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 YGL052WYGL052W 306 nt0.66□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.66□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 YPR092WYPR092W 306 nt0.66□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 PRP5YBR237W 2550 nt0.66□□□□□ -2.3
RUP1Q12242 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 COX5BYIL111W 456 nt0.65□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.65□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 UTP20YBL004W 7482 nt0.65□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 SEC8YPR055W 3198 nt0.64□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 YLR282CYLR282C 342 nt0.64□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.64□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.63□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.63□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.62□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.62□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.62□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.62□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.62□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.62□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.62□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.62□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.62□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 ULI1YFR026C 510 nt0.62□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.62□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 YMR160WYMR160W 2451 nt0.61□□□□□ -2.31
RUP1Q12242 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.61□□□□□ -2.31
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