Protein–RNA interactions for Protein: Q12210

YDL009C, Uncharacterized protein YDL009C, yeastyeast

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL009CQ12210 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.19□□□□□ -2.22
YDL009CQ12210 CDC39YCR093W 6327 nt1.19□□□□□ -2.22
YDL009CQ12210 GEA2YEL022W 4380 nt1.18□□□□□ -2.22
YDL009CQ12210 YDL196WYDL196W 330 nt1.18□□□□□ -2.22
YDL009CQ12210 OLI1Q0130 231 nt1.18□□□□□ -2.22
YDL009CQ12210 YLL020CYLL020C 306 nt1.18□□□□□ -2.22
YDL009CQ12210 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.18□□□□□ -2.22
YDL009CQ12210 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.18□□□□□ -2.22
YDL009CQ12210 SMC1YFL008W 3678 nt1.17□□□□□ -2.22
YDL009CQ12210 YCS4YLR272C 3531 nt1.17□□□□□ -2.22
YDL009CQ12210 PAM16YJL104W 450 nt1.17□□□□□ -2.22
YDL009CQ12210 WAR1YML076C 2835 nt1.17□□□□□ -2.22
YDL009CQ12210 PIK1YNL267W 3201 nt1.16□□□□□ -2.22
YDL009CQ12210 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.16□□□□□ -2.22
YDL009CQ12210 YOR345CYOR345C 351 nt1.16□□□□□ -2.22
YDL009CQ12210 ISD11YER048W-A 285 nt1.15□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.15□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 YNL211CYNL211C 261 nt1.15□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.15□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 CDC25YLR310C 4770 nt1.15□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 MSN5YDR335W 3675 nt1.14□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 HKR1YDR420W 5409 nt1.14□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 NUP145YGL092W 3954 nt1.14□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.13□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.13□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.13□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.13□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.13□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.13□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.13□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 ULI1YFR026C 510 nt1.13□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.13□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 RSM22YKL155C 1887 nt1.13□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 EAF1YDR359C 2949 nt1.12□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 STB6YKL072W 2301 nt1.12□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 PAA1YDR071C 576 nt1.12□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 APL1YJR005W 2103 nt1.12□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 FYV8YGR196C 2454 nt1.11□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.11□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 CMC4YMR194C-B 222 nt1.11□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 PET127YOR017W 2403 nt1.11□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.1□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 MSH3YCR092C 3057 nt1.09□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 RPS30BYOR182C 192 nt1.09□□□□□ -2.23
YDL009CQ12210 RAD9YDR217C 3930 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 NOP9YJL010C 2001 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 YEL014CYEL014C 306 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 NUP157YER105C 4176 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 SEC3YER008C 4011 nt1.08□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.07□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 YGR130CYGR130C 2451 nt1.06□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.06□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 COX12YLR038C 252 nt1.05□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 YPL044CYPL044C 549 nt1.05□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 TTI1YKL033W 3117 nt1.05□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 COY1YKL179C 2040 nt1.05□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 YNL337WYNL337W 255 nt1.04□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 RPL33BYOR234C 324 nt1.04□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.03□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.03□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.03□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.03□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 YNL198CYNL198C 303 nt1.03□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
YDL009CQ12210 ASE1YOR058C 2658 nt1.02□□□□□ -2.25
YDL009CQ12210 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.01□□□□□ -2.25
YDL009CQ12210 RPL26BYGR034W 384 nt1.01□□□□□ -2.25
YDL009CQ12210 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.01□□□□□ -2.25
YDL009CQ12210 snR52snR52 92 nt1.01□□□□□ -2.25
YDL009CQ12210 CLU1YMR012W 3834 nt1□□□□□ -2.25
YDL009CQ12210 YJL150WYJL150W 303 nt1□□□□□ -2.25
YDL009CQ12210 snR46snR46 197 nt1□□□□□ -2.25
YDL009CQ12210 HAL9YOL089C 3093 nt1□□□□□ -2.25
YDL009CQ12210 YLR282CYLR282C 342 nt0.99□□□□□ -2.25
YDL009CQ12210 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.98□□□□□ -2.25
YDL009CQ12210 PMP1YCR024C-A 123 nt0.97□□□□□ -2.25
YDL009CQ12210 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.97□□□□□ -2.25
YDL009CQ12210 snR190snR190 190 nt0.97□□□□□ -2.25
YDL009CQ12210 SPT7YBR081C 3999 nt0.97□□□□□ -2.25
YDL009CQ12210 BFR2YDR299W 1605 nt0.97□□□□□ -2.25
YDL009CQ12210 LAA1YJL207C 6045 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 IML1YJR138W 4755 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 COX5BYIL111W 456 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 YJL182CYJL182C 318 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 SIP4YJL089W 2490 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 KAP120YPL125W 3099 nt0.96□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.95□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.93□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.93□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 YML002WYML002W 2214 nt0.93□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 BUD3YCL014W 4911 nt0.92□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 ROM2YLR371W 4071 nt0.92□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 YJR029WYJR029W 5268 nt0.91□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.91□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 PRP39YML046W 1890 nt0.91□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 NST1YNL091W 3723 nt0.91□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 YEL073CYEL073C 324 nt0.91□□□□□ -2.26
YDL009CQ12210 YGR151CYGR151C 336 nt0.91□□□□□ -2.26
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