Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 ALY2YJL084C 3141 nt2.98□□□□□ -1.93
NCR1Q12200 JSN1YJR091C 3276 nt2.97□□□□□ -1.93
NCR1Q12200 BEM3YPL115C 3387 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YER138CYER138C 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YER160CYER160C 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YJR027WYJR027W 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YML039WYML039W 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YML045WYML045W 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YMR050CYMR050C 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 SEY1YOR165W 2331 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 CAF120YNL278W 3183 nt2.96□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 COA6YMR244C-A 315 nt2.95□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 BUD2YKL092C 3315 nt2.94□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.93□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YGR067CYGR067C 2415 nt2.93□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 VAS1YGR094W 3315 nt2.92□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt2.91□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 BPT1YLL015W 4680 nt2.91□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt2.91□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 MRD1YPR112C 2664 nt2.91□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 TRM3YDL112W 4311 nt2.91□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 RSE1YML049C 4086 nt2.91□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 TAF2YCR042C 4224 nt2.9□□□□□ -1.94
NCR1Q12200 snR70snR70 164 nt2.9□□□□□ -1.95
NCR1Q12200 ANS1YHR126C 480 nt2.9□□□□□ -1.95
NCR1Q12200 DSE4YNR067C 3354 nt2.9□□□□□ -1.95
NCR1Q12200 EST1YLR233C 2100 nt2.89□□□□□ -1.95
NCR1Q12200 MYO2YOR326W 4725 nt2.88□□□□□ -1.95
NCR1Q12200 SEC7YDR170C 6030 nt2.88□□□□□ -1.95
NCR1Q12200 RGR1YLR071C 3249 nt2.87□□□□□ -1.95
NCR1Q12200 YLR278CYLR278C 4026 nt2.87□□□□□ -1.95
NCR1Q12200 VPS8YAL002W 3825 nt2.86□□□□□ -1.95
NCR1Q12200 AGC1YPR021C 2709 nt2.85□□□□□ -1.95
NCR1Q12200 SIP4YJL089W 2490 nt2.85□□□□□ -1.95
NCR1Q12200 BUB1YGR188C 3066 nt2.85□□□□□ -1.95
NCR1Q12200 AXL1YPR122W 3627 nt2.85□□□□□ -1.95
NCR1Q12200 MOT1YPL082C 5604 nt2.85□□□□□ -1.95
NCR1Q12200 TRL1YJL087C 2484 nt2.84□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 CBF2YGR140W 2871 nt2.82□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 YPL216WYPL216W 3309 nt2.82□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 CYR1YJL005W 6081 nt2.82□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 CHS1YNL192W 3396 nt2.82□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 GCN2YDR283C 4980 nt2.82□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 SMC6YLR383W 3345 nt2.81□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 SRB8YCR081W 4284 nt2.81□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 PKH3YDR466W 2697 nt2.81□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 SAP1YER047C 2694 nt2.81□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 EST2YLR318W 2655 nt2.81□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 INP51YIL002C 2841 nt2.81□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.8□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 TOM1YDR457W 9807 nt2.8□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 SLH1YGR271W 5904 nt2.79□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 NAB6YML117W 3405 nt2.78□□□□□ -1.96
NCR1Q12200 SPC110YDR356W 2835 nt2.77□□□□□ -1.97
NCR1Q12200 DNA2YHR164C 4569 nt2.77□□□□□ -1.97
NCR1Q12200 snR190snR190 190 nt2.76□□□□□ -1.97
NCR1Q12200 TCB2YNL087W 3537 nt2.76□□□□□ -1.97
NCR1Q12200 FKS3YMR306W 5358 nt2.75□□□□□ -1.97
NCR1Q12200 RDS3YPR094W 324 nt2.75□□□□□ -1.97
NCR1Q12200 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt2.75□□□□□ -1.97
NCR1Q12200 SAC3YDR159W 3906 nt2.75□□□□□ -1.97
NCR1Q12200 ECM29YHL030W 5607 nt2.74□□□□□ -1.97
NCR1Q12200 snR69snR69 101 nt2.74□□□□□ -1.97
NCR1Q12200 PAN2YGL094C 3348 nt2.74□□□□□ -1.97
NCR1Q12200 BNR1YIL159W 4128 nt2.74□□□□□ -1.97
NCR1Q12200 SGS1YMR190C 4344 nt2.73□□□□□ -1.97
NCR1Q12200 ROM2YLR371W 4071 nt2.73□□□□□ -1.97
NCR1Q12200 snR14snR14 160 nt2.72□□□□□ -1.97
NCR1Q12200 TOF1YNL273W 3717 nt2.7□□□□□ -1.98
NCR1Q12200 ESC1YMR219W 4977 nt2.7□□□□□ -1.98
NCR1Q12200 NUP100YKL068W 2880 nt2.7□□□□□ -1.98
NCR1Q12200 CTR9YOL145C 3234 nt2.7□□□□□ -1.98
NCR1Q12200 YDR209CYDR209C 414 nt2.7□□□□□ -1.98
NCR1Q12200 PRP8YHR165C 7242 nt2.7□□□□□ -1.98
NCR1Q12200 YOR055WYOR055W 435 nt2.7□□□□□ -1.98
NCR1Q12200 PDR1YGL013C 3207 nt2.69□□□□□ -1.98
NCR1Q12200 MET18YIL128W 3099 nt2.68□□□□□ -1.98
NCR1Q12200 snR40snR40 97 nt2.67□□□□□ -1.98
NCR1Q12200 YEF3YLR249W 3135 nt2.66□□□□□ -1.98
NCR1Q12200 GYP5YPL249C 2685 nt2.65□□□□□ -1.98
NCR1Q12200 TFC3YAL001C 3483 nt2.65□□□□□ -1.98
NCR1Q12200 BUL2YML111W 2763 nt2.65□□□□□ -1.99
NCR1Q12200 YAR009CYAR009C 3591 nt2.65□□□□□ -1.99
NCR1Q12200 BCK1YJL095W 4437 nt2.65□□□□□ -1.99
NCR1Q12200 SIR4YDR227W 4077 nt2.63□□□□□ -1.99
NCR1Q12200 NUM1YDR150W 8247 nt2.63□□□□□ -1.99
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