Protein–RNA interactions for Protein: Q12104

SWT1, Transcriptional protein SWT1, yeastyeast

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SWT1Q12104 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.32□□□□□ -2.2
SWT1Q12104 YDL196WYDL196W 330 nt1.31□□□□□ -2.2
SWT1Q12104 APQ12YIL040W 417 nt1.31□□□□□ -2.2
SWT1Q12104 BLI1YKL061W 342 nt1.31□□□□□ -2.2
SWT1Q12104 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.31□□□□□ -2.2
SWT1Q12104 RSM22YKL155C 1887 nt1.31□□□□□ -2.2
SWT1Q12104 EAF1YDR359C 2949 nt1.3□□□□□ -2.2
SWT1Q12104 STB6YKL072W 2301 nt1.29□□□□□ -2.2
SWT1Q12104 ISD11YER048W-A 285 nt1.29□□□□□ -2.2
SWT1Q12104 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.29□□□□□ -2.2
SWT1Q12104 MEC1YBR136W 7107 nt1.29□□□□□ -2.2
SWT1Q12104 SMC1YFL008W 3678 nt1.29□□□□□ -2.2
SWT1Q12104 PIK1YNL267W 3201 nt1.28□□□□□ -2.2
SWT1Q12104 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.28□□□□□ -2.2
SWT1Q12104 YNL211CYNL211C 261 nt1.28□□□□□ -2.2
SWT1Q12104 CCH1YGR217W 6120 nt1.28□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 APL1YJR005W 2103 nt1.27□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 NUP157YER105C 4176 nt1.27□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 CLU1YMR012W 3834 nt1.27□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 SEC3YER008C 4011 nt1.26□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.26□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 PET127YOR017W 2403 nt1.26□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 ROM2YLR371W 4071 nt1.25□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 CMC4YMR194C-B 222 nt1.25□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.25□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 GEA2YEL022W 4380 nt1.24□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 FYV8YGR196C 2454 nt1.24□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 NOP9YJL010C 2001 nt1.24□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 PAA1YDR071C 576 nt1.24□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.24□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 PAM16YJL104W 450 nt1.24□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 YOR345CYOR345C 351 nt1.24□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.24□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 NUP192YJL039C 5052 nt1.23□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 RAD9YDR217C 3930 nt1.23□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 ULI1YFR026C 510 nt1.23□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.23□□□□□ -2.21
SWT1Q12104 YPL044CYPL044C 549 nt1.2□□□□□ -2.22
SWT1Q12104 CDC25YLR310C 4770 nt1.2□□□□□ -2.22
SWT1Q12104 RPS30BYOR182C 192 nt1.19□□□□□ -2.22
SWT1Q12104 CDC31YOR257W 486 nt1.19□□□□□ -2.22
SWT1Q12104 TTI1YKL033W 3117 nt1.19□□□□□ -2.22
SWT1Q12104 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.18□□□□□ -2.22
SWT1Q12104 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.18□□□□□ -2.22
SWT1Q12104 COX12YLR038C 252 nt1.18□□□□□ -2.22
SWT1Q12104 KAP120YPL125W 3099 nt1.18□□□□□ -2.22
SWT1Q12104 ASE1YOR058C 2658 nt1.17□□□□□ -2.22
SWT1Q12104 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.17□□□□□ -2.22
SWT1Q12104 ANS1YHR126C 480 nt1.17□□□□□ -2.22
SWT1Q12104 HAL9YOL089C 3093 nt1.17□□□□□ -2.22
SWT1Q12104 CAT8YMR280C 4302 nt1.17□□□□□ -2.22
SWT1Q12104 YEL014CYEL014C 306 nt1.15□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 RPL26BYGR034W 384 nt1.15□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.15□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 COY1YKL179C 2040 nt1.15□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.14□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 RPL33BYOR234C 324 nt1.13□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.12□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 YLR282CYLR282C 342 nt1.11□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.11□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 snR46snR46 197 nt1.11□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.1□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.09□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.09□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.09□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.09□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.09□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.09□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.09□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.09□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 COX5BYIL111W 456 nt1.09□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 YNL337WYNL337W 255 nt1.09□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 snR190snR190 190 nt1.09□□□□□ -2.23
SWT1Q12104 NST1YNL091W 3723 nt1.09□□□□□ -2.24
SWT1Q12104 PMP1YCR024C-A 123 nt1.08□□□□□ -2.24
SWT1Q12104 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.08□□□□□ -2.24
SWT1Q12104 BFR2YDR299W 1605 nt1.07□□□□□ -2.24
SWT1Q12104 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.07□□□□□ -2.24
SWT1Q12104 PRP16YKR086W 3216 nt1.06□□□□□ -2.24
SWT1Q12104 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.05□□□□□ -2.24
SWT1Q12104 SPT7YBR081C 3999 nt1.05□□□□□ -2.24
SWT1Q12104 MSH3YCR092C 3057 nt1.05□□□□□ -2.24
SWT1Q12104 SEC8YPR055W 3198 nt1.05□□□□□ -2.24
SWT1Q12104 YML002WYML002W 2214 nt1.04□□□□□ -2.24
SWT1Q12104 YJL150WYJL150W 303 nt1.04□□□□□ -2.24
SWT1Q12104 snR52snR52 92 nt1.04□□□□□ -2.24
SWT1Q12104 YJL182CYJL182C 318 nt1.03□□□□□ -2.24
SWT1Q12104 YDL073WYDL073W 2955 nt1.03□□□□□ -2.24
SWT1Q12104 YLR041WYLR041W 321 nt1.02□□□□□ -2.25
SWT1Q12104 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.02□□□□□ -2.25
SWT1Q12104 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1□□□□□ -2.25
SWT1Q12104 YNL198CYNL198C 303 nt1□□□□□ -2.25
SWT1Q12104 FYV10YIL097W 1551 nt1□□□□□ -2.25
SWT1Q12104 YEL073CYEL073C 324 nt0.99□□□□□ -2.25
SWT1Q12104 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.99□□□□□ -2.25
SWT1Q12104 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
SWT1Q12104 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
SWT1Q12104 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.99□□□□□ -2.25
SWT1Q12104 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
SWT1Q12104 YGR130CYGR130C 2451 nt0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.5 ms