Protein–RNA interactions for Protein: P0CX22

YRF1-8, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 8, yeastyeast

Predictions only

Length 1,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-8P0CX22 snR36snR36 182 nt-0.87□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 BER1YLR412W 825 nt-0.88□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 snR5snR5 204 nt-0.88□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.88□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-0.89□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 snR161snR161 161 nt-0.89□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 HUR1YGL168W 333 nt-0.9□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 YLR217WYLR217W 324 nt-0.91□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 YPT6YLR262C 648 nt-0.91□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 YPR039WYPR039W 336 nt-0.91□□□□□ -2.55
YRF1-8P0CX22 YGR228WYGR228W 345 nt-0.91□□□□□ -2.56
YRF1-8P0CX22 YOL029CYOL029C 606 nt-0.91□□□□□ -2.56
YRF1-8P0CX22 MRPL32YCR003W 552 nt-0.92□□□□□ -2.56
YRF1-8P0CX22 PCF11YDR228C 1881 nt-0.92□□□□□ -2.56
YRF1-8P0CX22 APQ13YJL075C 417 nt-0.94□□□□□ -2.56
YRF1-8P0CX22 YPL182CYPL182C 384 nt-0.94□□□□□ -2.56
YRF1-8P0CX22 RPF1YHR088W 888 nt-0.95□□□□□ -2.56
YRF1-8P0CX22 CUP1-1YHR053C 186 nt-0.96□□□□□ -2.56
YRF1-8P0CX22 CUP1-2YHR055C 186 nt-0.96□□□□□ -2.56
YRF1-8P0CX22 TAR1YLR154W-C 375 nt-0.96□□□□□ -2.56
YRF1-8P0CX22 POP7YBR167C 423 nt-0.96□□□□□ -2.56
YRF1-8P0CX22 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-0.97□□□□□ -2.56
YRF1-8P0CX22 MATALPHA2YCR039C 633 nt-0.97□□□□□ -2.56
YRF1-8P0CX22 HMRA2YCR096C 360 nt-0.97□□□□□ -2.56
YRF1-8P0CX22 EST1YLR233C 2100 nt-0.97□□□□□ -2.56
YRF1-8P0CX22 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.98□□□□□ -2.57
YRF1-8P0CX22 RPS25BYLR333C 327 nt-0.98□□□□□ -2.57
YRF1-8P0CX22 SDH7YDR511W 402 nt-0.98□□□□□ -2.57
YRF1-8P0CX22 YHL041WYHL041W 450 nt-0.98□□□□□ -2.57
YRF1-8P0CX22 SGF11YPL047W 300 nt-0.99□□□□□ -2.57
YRF1-8P0CX22 YCR100CYCR100C 951 nt-1□□□□□ -2.57
YRF1-8P0CX22 YNL058CYNL058C 951 nt-1□□□□□ -2.57
YRF1-8P0CX22 TSC3YBR058C-A 243 nt-1□□□□□ -2.57
YRF1-8P0CX22 YCR001WYCR001W 315 nt-1.01□□□□□ -2.57
YRF1-8P0CX22 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-1.01□□□□□ -2.57
YRF1-8P0CX22 YPR092WYPR092W 306 nt-1.01□□□□□ -2.57
YRF1-8P0CX22 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-1.03□□□□□ -2.57
YRF1-8P0CX22 YER135CYER135C 393 nt-1.03□□□□□ -2.57
YRF1-8P0CX22 YDL011CYDL011C 324 nt-1.03□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 YML007C-AYML007C-A 111 nt-1.03□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 SNU13YEL026W 381 nt-1.04□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 YER079WYER079W 633 nt-1.04□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 AGA2YGL032C 264 nt-1.04□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 YGR025WYGR025W 303 nt-1.04□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 BLI1YKL061W 342 nt-1.04□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-1.04□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 YGL230CYGL230C 444 nt-1.05□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 YLR041WYLR041W 321 nt-1.05□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 YER175W-AYER175W-A 165 nt-1.06□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 YML100W-AYML100W-A 174 nt-1.06□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 YLR282CYLR282C 342 nt-1.06□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 snR9snR9 187 nt-1.07□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 YLR334CYLR334C 381 nt-1.07□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 MND1YGL183C 660 nt-1.08□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 PAU9YBL108C-A 129 nt-1.08□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-1.09□□□□□ -2.58
YRF1-8P0CX22 FYV7YLR068W 456 nt-1.1□□□□□ -2.59
YRF1-8P0CX22 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-1.11□□□□□ -2.59
YRF1-8P0CX22 CMC1YKL137W 336 nt-1.11□□□□□ -2.59
YRF1-8P0CX22 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-1.12□□□□□ -2.59
YRF1-8P0CX22 YHR130CYHR130C 336 nt-1.13□□□□□ -2.59
YRF1-8P0CX22 YBL062WYBL062W 381 nt-1.13□□□□□ -2.59
YRF1-8P0CX22 YNL303WYNL303W 348 nt-1.13□□□□□ -2.59
YRF1-8P0CX22 YOR015WYOR015W 360 nt-1.13□□□□□ -2.59
YRF1-8P0CX22 YDR366CYDR366C 399 nt-1.14□□□□□ -2.59
YRF1-8P0CX22 YMR254CYMR254C 309 nt-1.15□□□□□ -2.59
YRF1-8P0CX22 ZEO1YOL109W 342 nt-1.15□□□□□ -2.59
YRF1-8P0CX22 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-1.15□□□□□ -2.59
YRF1-8P0CX22 YPL068CYPL068C 882 nt-1.16□□□□□ -2.59
YRF1-8P0CX22 YBL071CYBL071C 309 nt-1.18□□□□□ -2.6
YRF1-8P0CX22 YDR426CYDR426C 378 nt-1.19□□□□□ -2.6
YRF1-8P0CX22 YKL044WYKL044W 321 nt-1.2□□□□□ -2.6
YRF1-8P0CX22 AIM29YKR074W 468 nt-1.2□□□□□ -2.6
YRF1-8P0CX22 YPL229WYPL229W 621 nt-1.2□□□□□ -2.6
YRF1-8P0CX22 SCEIQ0160 708 nt-1.21□□□□□ -2.6
YRF1-8P0CX22 YAR029WYAR029W 225 nt-1.21□□□□□ -2.6
YRF1-8P0CX22 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-1.21□□□□□ -2.6
YRF1-8P0CX22 YKL083WYKL083W 615 nt-1.22□□□□□ -2.6
YRF1-8P0CX22 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-1.22□□□□□ -2.6
YRF1-8P0CX22 YER084W-AYER084W-A 513 nt-1.23□□□□□ -2.61
YRF1-8P0CX22 SDH6YDR379C-A 240 nt-1.24□□□□□ -2.61
YRF1-8P0CX22 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-1.24□□□□□ -2.61
YRF1-8P0CX22 YJL182CYJL182C 318 nt-1.26□□□□□ -2.61
YRF1-8P0CX22 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-1.26□□□□□ -2.61
YRF1-8P0CX22 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-1.28□□□□□ -2.61
YRF1-8P0CX22 YGL182CYGL182C 324 nt-1.29□□□□□ -2.62
YRF1-8P0CX22 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-1.3□□□□□ -2.62
YRF1-8P0CX22 APQ12YIL040W 417 nt-1.31□□□□□ -2.62
YRF1-8P0CX22 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-1.32□□□□□ -2.62
YRF1-8P0CX22 YJR087WYJR087W 351 nt-1.33□□□□□ -2.62
YRF1-8P0CX22 YIL029CYIL029C 429 nt-1.34□□□□□ -2.62
YRF1-8P0CX22 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-1.34□□□□□ -2.62
YRF1-8P0CX22 snR49snR49 165 nt-1.34□□□□□ -2.62
YRF1-8P0CX22 YDL016CYDL016C 303 nt-1.34□□□□□ -2.62
YRF1-8P0CX22 YIL032CYIL032C 357 nt-1.35□□□□□ -2.63
YRF1-8P0CX22 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-1.36□□□□□ -2.63
YRF1-8P0CX22 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-1.36□□□□□ -2.63
YRF1-8P0CX22 YFL063WYFL063W 456 nt-1.38□□□□□ -2.63
YRF1-8P0CX22 CBS1YDL069C 690 nt-1.39□□□□□ -2.63
YRF1-8P0CX22 YFL012WYFL012W 447 nt-1.39□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.6 ms