Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ARID3CA6NKF2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
ARID3CA6NKF2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms