Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx6Q9ER75 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms