Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM106CQ9BVX2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms