Protein–RNA interactions for Protein: Q3E7Z2

YNL042W-B, Uncharacterized protein YNL042W-B, yeast

Predictions only

Length 85 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL042W-B	Q3E7Z2	YPR170W-A	YPR170W-A	186 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
YNL042W-B	Q3E7Z2	PAA1	YDR071C	576 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
YNL042W-B	Q3E7Z2	HTB1	YDR224C	396 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
YNL042W-B	Q3E7Z2	YJL007C	YJL007C	315 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
YNL042W-B	Q3E7Z2	YAP6	YDR259C	1152 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	LRP1	YHR081W	555 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	HTB2	YBL002W	396 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	SNU56	YDR240C	1479 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDR269C	YDR269C	324 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	LIN1	YHR156C	1023 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	RPS30A	YLR287C-A	192 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	ACF4	YJR083C	930 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOR020W-A	YOR020W-A	273 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBL008W-A	YBL008W-A	240 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	SPC24	YMR117C	642 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	YMR304C-A	YMR304C-A	351 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	NIP100	YPL174C	2607 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	SPO21	YOL091W	1830 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	RRI2	YOL117W	1938 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	YHR050W-A	YHR050W-A	171 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOR248W	YOR248W	303 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	POL32	YJR043C	1053 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
YNL042W-B	Q3E7Z2	CWC23	YGL128C	852 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	YPL205C	YPL205C	345 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	tN(GUU)Q	tN(GUU)Q	71 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	YHL046W-A	YHL046W-A	327 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	ATG16	YMR159C	453 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	PBI2	YNL015W	228 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOL160W	YOL160W	342 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	GLG1	YKR058W	1851 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	YER188C-A	YER188C-A	300 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	YHR131W-A	YHR131W-A	246 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	YJR141W	YJR141W	1044 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDR220C	YDR220C	294 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBR206W	YBR206W	324 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	YIR044C	YIR044C	186 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	YMR075C-A	YMR075C-A	366 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	IRC16	YPR038W	360 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	UBS1	YBR165W	834 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	LOC1	YFR001W	615 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	YML108W	YML108W	318 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	YPL261C	YPL261C	309 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
YNL042W-B	Q3E7Z2	DIE2	YGR227W	1578 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	YCR022C	YCR022C	345 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	YNL146C-A	YNL146C-A	195 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	YLL006W-A	YLL006W-A	177 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	YLR171W	YLR171W	390 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	YMR013C-A	YMR013C-A	150 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	EMC4	YGL231C	573 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	DCP1	YOL149W	696 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	SEM1	YDR363W-A	270 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	RPL22B	YFL034C-A	369 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR72	snR72	98 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	ECL1	YGR146C	636 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	VAM3	YOR106W	852 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	SRB7	YDR308C	423 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
YNL042W-B	Q3E7Z2	YJL026C-A	YJL026C-A	222 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
YNL042W-B	Q3E7Z2	YNL319W	YNL319W	441 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
YNL042W-B	Q3E7Z2	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
YNL042W-B	Q3E7Z2	PTP2	YOR208W	2253 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDL185C-A	YDL185C-A	228 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
YNL042W-B	Q3E7Z2	IPP1	YBR011C	864 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
YNL042W-B	Q3E7Z2	YPR096C	YPR096C	303 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
YNL042W-B	Q3E7Z2	YGL239C	YGL239C	315 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
YNL042W-B	Q3E7Z2	ILM1	YJR118C	612 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
YNL042W-B	Q3E7Z2	YGL015C	YGL015C	393 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
YNL042W-B	Q3E7Z2	YGR115C	YGR115C	780 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
YNL042W-B	Q3E7Z2	RPM2	YML091C	3609 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
YNL042W-B	Q3E7Z2	YKL202W	YKL202W	582 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	YMR307C-A	YMR307C-A	195 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR33	snR33	183 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	BUD26	YDR241W	288 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	YCR018C-A	YCR018C-A	255 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	YLR287C	YLR287C	1068 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	YNL067W-B	YNL067W-B	141 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR34	snR34	203 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	RPS20	YHL015W	366 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	YGR228W	YGR228W	345 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	APQ13	YJL075C	417 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	YJL120W	YJL120W	324 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR36	snR36	182 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR51	snR51	107 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	YGR270C-A	YGR270C-A	219 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	YPR039W	YPR039W	336 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBR099C	YBR099C	384 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
YNL042W-B	Q3E7Z2	PCF11	YDR228C	1881 nt		-0.97	□□□□□ -2.57
YNL042W-B	Q3E7Z2	SDH7	YDR511W	402 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
YNL042W-B	Q3E7Z2	TIM13	YGR181W	318 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
YNL042W-B	Q3E7Z2	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
YNL042W-B	Q3E7Z2	MRPS8	YMR158W	468 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
YNL042W-B	Q3E7Z2	ATG31	YDR022C	591 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
YNL042W-B	Q3E7Z2	BER1	YLR412W	825 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOL029C	YOL029C	606 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBL107W-A	YBL107W-A	105 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
YNL042W-B	Q3E7Z2	YPR092W	YPR092W	306 nt		-0.99	□□□□□ -2.57

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 93.4 ms