Protein–RNA interactions for Protein: Q08553

SYC1, Protein SYC1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYC1Q08553 MRPL50YNR022C 420 nt0.6□□□□□ -2.31
SYC1Q08553 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SYC1Q08553 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SYC1Q08553 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SYC1Q08553 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SYC1Q08553 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SYC1Q08553 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SYC1Q08553 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SYC1Q08553 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SYC1Q08553 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SYC1Q08553 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SYC1Q08553 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
SYC1Q08553 ISF1YMR081C 1017 nt0.59□□□□□ -2.31
SYC1Q08553 CUL3YGR003W 2235 nt0.57□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 YDR344CYDR344C 444 nt0.57□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 YOR029WYOR029W 336 nt0.57□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 YBR064WYBR064W 429 nt0.57□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 ATG31YDR022C 591 nt0.56□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.56□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 MAM33YIL070C 801 nt0.56□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 YIR044CYIR044C 186 nt0.56□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 YJR011CYJR011C 786 nt0.56□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 YOR282WYOR282W 321 nt0.56□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 RPS20YHL015W 366 nt0.55□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.55□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 RPS24BYIL069C 408 nt0.55□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.55□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 UTP10YJL109C 5310 nt0.55□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 YLL007CYLL007C 1998 nt0.54□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 PMP1YCR024C-A 123 nt0.54□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 ECM12YHR021W-A 456 nt0.54□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 YBR206WYBR206W 324 nt0.54□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 PRP16YKR086W 3216 nt0.53□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 NOP9YJL010C 2001 nt0.53□□□□□ -2.32
SYC1Q08553 NIP100YPL174C 2607 nt0.52□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 LTE1YAL024C 4308 nt0.52□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 YML002WYML002W 2214 nt0.52□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 STF2YGR008C 255 nt0.52□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 INA22YIR024C 651 nt0.52□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.52□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.52□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 YCK3YER123W 1575 nt0.52□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 MCM10YIL150C 1716 nt0.52□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 CHS6YJL099W 2241 nt0.51□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.51□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 NPR2YEL062W 1848 nt0.5□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 OST1YJL002C 1431 nt0.5□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 OLI1Q0130 231 nt0.5□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 RPS30BYOR182C 192 nt0.5□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 PTP2YOR208W 2253 nt0.5□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 RPL38YLR325C 237 nt0.49□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 YLR456WYLR456W 615 nt0.49□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 YPL044CYPL044C 549 nt0.49□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 HUG1YML058W-A 207 nt0.48□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 YMR160WYMR160W 2451 nt0.48□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 YDR426CYDR426C 378 nt0.47□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 YLR434CYLR434C 384 nt0.47□□□□□ -2.33
SYC1Q08553 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.46□□□□□ -2.34
SYC1Q08553 BSC3YLR465C 309 nt0.46□□□□□ -2.34
SYC1Q08553 YPL185WYPL185W 396 nt0.46□□□□□ -2.34
SYC1Q08553 YJL007CYJL007C 315 nt0.44□□□□□ -2.34
SYC1Q08553 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.43□□□□□ -2.34
SYC1Q08553 RPL26BYGR034W 384 nt0.42□□□□□ -2.34
SYC1Q08553 PCC1YKR095W-A 267 nt0.42□□□□□ -2.34
SYC1Q08553 ASE1YOR058C 2658 nt0.41□□□□□ -2.34
SYC1Q08553 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.41□□□□□ -2.34
SYC1Q08553 YOR218CYOR218C 420 nt0.41□□□□□ -2.34
SYC1Q08553 SPO21YOL091W 1830 nt0.41□□□□□ -2.34
SYC1Q08553 YNL211CYNL211C 261 nt0.4□□□□□ -2.35
SYC1Q08553 YPL068CYPL068C 882 nt0.4□□□□□ -2.35
SYC1Q08553 PAA1YDR071C 576 nt0.39□□□□□ -2.35
SYC1Q08553 YKL063CYKL063C 504 nt0.39□□□□□ -2.35
SYC1Q08553 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.39□□□□□ -2.35
SYC1Q08553 YOR053WYOR053W 342 nt0.39□□□□□ -2.35
SYC1Q08553 YPL205CYPL205C 345 nt0.39□□□□□ -2.35
SYC1Q08553 FYV10YIL097W 1551 nt0.39□□□□□ -2.35
SYC1Q08553 YLR334CYLR334C 381 nt0.38□□□□□ -2.35
SYC1Q08553 VPS20YMR077C 666 nt0.38□□□□□ -2.35
SYC1Q08553 HMRA2YCR096C 360 nt0.37□□□□□ -2.35
SYC1Q08553 CSN9YDR179C 489 nt0.37□□□□□ -2.35
SYC1Q08553 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.37□□□□□ -2.35
SYC1Q08553 UTP20YBL004W 7482 nt0.36□□□□□ -2.35
SYC1Q08553 SGF11YPL047W 300 nt0.35□□□□□ -2.35
SYC1Q08553 YSP1YHR155W 3687 nt0.34□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 PRM3YPL192C 402 nt0.34□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 SBH1YER087C-B 249 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 PAU12YGR294W 363 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 COX5BYIL111W 456 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 TAR1YLR154W-C 375 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 YLR202CYLR202C 327 nt0.33□□□□□ -2.36
SYC1Q08553 YPL225WYPL225W 441 nt0.33□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 112.4 ms