Protein–RNA interactions for Protein: Q04461

YMR111C, Uncharacterized protein YMR111C, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR111CQ04461 ATG31YDR022C 591 nt0.82□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 YOR282WYOR282W 321 nt0.82□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 RPS20YHL015W 366 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 YNL324WYNL324W 396 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 snR72snR72 98 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 ISF1YMR081C 1017 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 ALG13YGL047W 609 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 YHL041WYHL041W 450 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 RPL26AYLR344W 384 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 RPS30BYOR182C 192 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 YPL068CYPL068C 882 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 DBP6YNR038W 1890 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 YLL007CYLL007C 1998 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 YLR202CYLR202C 327 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR111CQ04461 SWF1YDR126W 1011 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR111CQ04461 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR111CQ04461 NIP100YPL174C 2607 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR111CQ04461 NHP2YDL208W 471 nt0.76□□□□□ -2.29
YMR111CQ04461 MAM33YIL070C 801 nt0.76□□□□□ -2.29
YMR111CQ04461 PCC1YKR095W-A 267 nt0.75□□□□□ -2.29
YMR111CQ04461 IES4YOR189W 351 nt0.75□□□□□ -2.29
YMR111CQ04461 YSP1YHR155W 3687 nt0.75□□□□□ -2.29
YMR111CQ04461 YDR521WYDR521W 336 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR111CQ04461 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR111CQ04461 INA22YIR024C 651 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR111CQ04461 YGR042WYGR042W 816 nt0.73□□□□□ -2.29
YMR111CQ04461 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.73□□□□□ -2.29
YMR111CQ04461 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.72□□□□□ -2.29
YMR111CQ04461 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.71□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 CMC4YMR194C-B 222 nt0.71□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 PRM3YPL192C 402 nt0.71□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 SEC1YDR164C 2175 nt0.71□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 OST1YJL002C 1431 nt0.71□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 UTP20YBL004W 7482 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 YPL044CYPL044C 549 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 HMRA2YCR096C 360 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 PAA1YDR071C 576 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 YDR426CYDR426C 378 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 VPS20YMR077C 666 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 PMP1YCR024C-A 123 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 YJR011CYJR011C 786 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 YLR434CYLR434C 384 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 IQG1YPL242C 4488 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 SPO21YOL091W 1830 nt0.67□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 YMR160WYMR160W 2451 nt0.66□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 YCK3YER123W 1575 nt0.66□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 AGA2YGL032C 264 nt0.66□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.66□□□□□ -2.3
YMR111CQ04461 BSC3YLR465C 309 nt0.65□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 YOR053WYOR053W 342 nt0.65□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 NOP9YJL010C 2001 nt0.65□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 OLI1Q0130 231 nt0.63□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 YBR285WYBR285W 435 nt0.62□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 BEM3YPL115C 3387 nt0.62□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 GEA2YEL022W 4380 nt0.62□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 YML002WYML002W 2214 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 UTP10YJL109C 5310 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 RPL26BYGR034W 384 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 ECM12YHR021W-A 456 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 YOR218CYOR218C 420 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 YBR064WYBR064W 429 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 YBR206WYBR206W 324 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 BFR2YDR299W 1605 nt0.6□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 MLP1YKR095W 5628 nt0.6□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 YOR121CYOR121C 306 nt0.6□□□□□ -2.31
YMR111CQ04461 MLP2YIL149C 5040 nt0.59□□□□□ -2.32
YMR111CQ04461 NPR2YEL062W 1848 nt0.59□□□□□ -2.32
YMR111CQ04461 YER079WYER079W 633 nt0.58□□□□□ -2.32
YMR111CQ04461 PAU12YGR294W 363 nt0.58□□□□□ -2.32
YMR111CQ04461 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.58□□□□□ -2.32
YMR111CQ04461 SEC8YPR055W 3198 nt0.57□□□□□ -2.32
YMR111CQ04461 YDR344CYDR344C 444 nt0.57□□□□□ -2.32
YMR111CQ04461 QCR9YGR183C 201 nt0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24 ms