Protein–RNA interactions for Protein: P53187

HOP2, Homologous-pairing protein 2, yeastyeast

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HOP2P53187 PET111YMR257C 2403 nt0.13□□□□□ -2.39
HOP2P53187 BIG1YHR101C 1008 nt0.13□□□□□ -2.39
HOP2P53187 DCP1YOL149W 696 nt0.13□□□□□ -2.39
HOP2P53187 YBR064WYBR064W 429 nt0.13□□□□□ -2.39
HOP2P53187 MCM10YIL150C 1716 nt0.13□□□□□ -2.39
HOP2P53187 RAD34YDR314C 2079 nt0.12□□□□□ -2.39
HOP2P53187 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.12□□□□□ -2.39
HOP2P53187 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.12□□□□□ -2.39
HOP2P53187 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.12□□□□□ -2.39
HOP2P53187 YKL202WYKL202W 582 nt0.12□□□□□ -2.39
HOP2P53187 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.12□□□□□ -2.39
HOP2P53187 BER1YLR412W 825 nt0.12□□□□□ -2.39
HOP2P53187 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.11□□□□□ -2.39
HOP2P53187 snR72snR72 98 nt0.11□□□□□ -2.39
HOP2P53187 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.11□□□□□ -2.39
HOP2P53187 SVS1YPL163C 783 nt0.11□□□□□ -2.39
HOP2P53187 VIK1YPL253C 1944 nt0.11□□□□□ -2.39
HOP2P53187 ASE1YOR058C 2658 nt0.1□□□□□ -2.39
HOP2P53187 YJR141WYJR141W 1044 nt0.1□□□□□ -2.39
HOP2P53187 RPS27AYKL156W 249 nt0.1□□□□□ -2.39
HOP2P53187 YPL182CYPL182C 384 nt0.1□□□□□ -2.39
HOP2P53187 INP2YMR163C 2118 nt0.1□□□□□ -2.39
HOP2P53187 OLI1Q0130 231 nt0.09□□□□□ -2.4
HOP2P53187 YIR044CYIR044C 186 nt0.09□□□□□ -2.4
HOP2P53187 EMC4YGL231C 573 nt0.08□□□□□ -2.4
HOP2P53187 TSC3YBR058C-A 243 nt0.08□□□□□ -2.4
HOP2P53187 HAL9YOL089C 3093 nt0.08□□□□□ -2.4
HOP2P53187 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.07□□□□□ -2.4
HOP2P53187 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.07□□□□□ -2.4
HOP2P53187 SNU56YDR240C 1479 nt0.06□□□□□ -2.4
HOP2P53187 CUL3YGR003W 2235 nt0.05□□□□□ -2.4
HOP2P53187 YDL016CYDL016C 303 nt0.05□□□□□ -2.4
HOP2P53187 TIM13YGR181W 318 nt0.05□□□□□ -2.4
HOP2P53187 THO2YNL139C 4794 nt0.04□□□□□ -2.4
HOP2P53187 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.04□□□□□ -2.4
HOP2P53187 PBI2YNL015W 228 nt0.04□□□□□ -2.4
HOP2P53187 YBR206WYBR206W 324 nt0.04□□□□□ -2.4
HOP2P53187 snR51snR51 107 nt0.04□□□□□ -2.4
HOP2P53187 YAP6YDR259C 1152 nt0.03□□□□□ -2.4
HOP2P53187 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.03□□□□□ -2.4
HOP2P53187 Q0255Q0255 1419 nt0.03□□□□□ -2.41
HOP2P53187 YCR001WYCR001W 315 nt0.02□□□□□ -2.41
HOP2P53187 COX12YLR038C 252 nt0.02□□□□□ -2.41
HOP2P53187 PRP5YBR237W 2550 nt0.01□□□□□ -2.41
HOP2P53187 NFU1YKL040C 771 nt0.01□□□□□ -2.41
HOP2P53187 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.01□□□□□ -2.41
HOP2P53187 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0□□□□□ -2.41
HOP2P53187 OST4YDL232W 111 nt0□□□□□ -2.41
HOP2P53187 SDH7YDR511W 402 nt0□□□□□ -2.41
HOP2P53187 PAA1YDR071C 576 nt-0.01□□□□□ -2.41
HOP2P53187 RPS20YHL015W 366 nt-0.01□□□□□ -2.41
HOP2P53187 COX5BYIL111W 456 nt-0.01□□□□□ -2.41
HOP2P53187 YJR011CYJR011C 786 nt-0.01□□□□□ -2.41
HOP2P53187 YML108WYML108W 318 nt-0.01□□□□□ -2.41
HOP2P53187 MAM33YIL070C 801 nt-0.02□□□□□ -2.41
HOP2P53187 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.02□□□□□ -2.41
HOP2P53187 BUL2YML111W 2763 nt-0.02□□□□□ -2.41
HOP2P53187 RCO1YMR075W 2055 nt-0.02□□□□□ -2.41
HOP2P53187 ORC3YLL004W 1851 nt-0.03□□□□□ -2.41
HOP2P53187 PRP42YDR235W 1635 nt-0.03□□□□□ -2.41
HOP2P53187 SPO21YOL091W 1830 nt-0.03□□□□□ -2.42
HOP2P53187 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.04□□□□□ -2.42
HOP2P53187 YLR269CYLR269C 351 nt-0.04□□□□□ -2.42
HOP2P53187 NIP100YPL174C 2607 nt-0.04□□□□□ -2.42
HOP2P53187 PTP2YOR208W 2253 nt-0.04□□□□□ -2.42
HOP2P53187 YDL011CYDL011C 324 nt-0.05□□□□□ -2.42
HOP2P53187 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.06□□□□□ -2.42
HOP2P53187 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.06□□□□□ -2.42
HOP2P53187 YNL211CYNL211C 261 nt-0.06□□□□□ -2.42
HOP2P53187 YOR053WYOR053W 342 nt-0.06□□□□□ -2.42
HOP2P53187 snR45snR45 172 nt-0.06□□□□□ -2.42
HOP2P53187 YHL041WYHL041W 450 nt-0.07□□□□□ -2.42
HOP2P53187 RPF1YHR088W 888 nt-0.07□□□□□ -2.42
HOP2P53187 YBL071CYBL071C 309 nt-0.07□□□□□ -2.42
HOP2P53187 GPI15YNL038W 690 nt-0.08□□□□□ -2.42
HOP2P53187 LEE1YPL054W 906 nt-0.08□□□□□ -2.42
HOP2P53187 RPS26AYGL189C 360 nt-0.09□□□□□ -2.42
HOP2P53187 YLR171WYLR171W 390 nt-0.09□□□□□ -2.42
HOP2P53187 YOR345CYOR345C 351 nt-0.09□□□□□ -2.42
HOP2P53187 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.1□□□□□ -2.43
HOP2P53187 YNL058CYNL058C 951 nt-0.1□□□□□ -2.43
HOP2P53187 ATG31YDR022C 591 nt-0.11□□□□□ -2.43
HOP2P53187 YPL229WYPL229W 621 nt-0.11□□□□□ -2.43
HOP2P53187 snR190snR190 190 nt-0.11□□□□□ -2.43
HOP2P53187 MYO1YHR023W 5787 nt-0.11□□□□□ -2.43
HOP2P53187 RPL35AYDL191W 363 nt-0.12□□□□□ -2.43
HOP2P53187 SSS1YDR086C 243 nt-0.13□□□□□ -2.43
HOP2P53187 YNL146WYNL146W 303 nt-0.13□□□□□ -2.43
HOP2P53187 COG8YML071C 1824 nt-0.13□□□□□ -2.43
HOP2P53187 ULI1YFR026C 510 nt-0.14□□□□□ -2.43
HOP2P53187 NNF2YGR089W 2811 nt-0.14□□□□□ -2.43
HOP2P53187 YFL012WYFL012W 447 nt-0.15□□□□□ -2.43
HOP2P53187 YLR232WYLR232W 348 nt-0.15□□□□□ -2.43
HOP2P53187 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.15□□□□□ -2.43
HOP2P53187 ZEO1YOL109W 342 nt-0.15□□□□□ -2.43
HOP2P53187 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.16□□□□□ -2.44
HOP2P53187 MRPL50YNR022C 420 nt-0.16□□□□□ -2.44
HOP2P53187 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.16□□□□□ -2.44
HOP2P53187 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-0.16□□□□□ -2.44
HOP2P53187 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.17□□□□□ -2.44
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