Protein–RNA interactions for Protein: P35718

RPC25, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, yeastyeast

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC25P35718 ATG31YDR022C 591 nt0.73□□□□□ -2.29
RPC25P35718 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.73□□□□□ -2.29
RPC25P35718 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.73□□□□□ -2.29
RPC25P35718 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.73□□□□□ -2.29
RPC25P35718 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.73□□□□□ -2.29
RPC25P35718 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
RPC25P35718 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
RPC25P35718 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.73□□□□□ -2.29
RPC25P35718 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
RPC25P35718 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
RPC25P35718 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
RPC25P35718 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
RPC25P35718 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.73□□□□□ -2.29
RPC25P35718 IES4YOR189W 351 nt0.73□□□□□ -2.29
RPC25P35718 GEA2YEL022W 4380 nt0.73□□□□□ -2.29
RPC25P35718 CUL3YGR003W 2235 nt0.73□□□□□ -2.29
RPC25P35718 OST1YJL002C 1431 nt0.72□□□□□ -2.29
RPC25P35718 NIP100YPL174C 2607 nt0.71□□□□□ -2.3
RPC25P35718 RPS20YHL015W 366 nt0.7□□□□□ -2.3
RPC25P35718 MAM33YIL070C 801 nt0.7□□□□□ -2.3
RPC25P35718 YOR282WYOR282W 321 nt0.7□□□□□ -2.3
RPC25P35718 BFR2YDR299W 1605 nt0.69□□□□□ -2.3
RPC25P35718 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.69□□□□□ -2.3
RPC25P35718 YJL007CYJL007C 315 nt0.68□□□□□ -2.3
RPC25P35718 YJR011CYJR011C 786 nt0.68□□□□□ -2.3
RPC25P35718 YLL007CYLL007C 1998 nt0.68□□□□□ -2.3
RPC25P35718 RPL38YLR325C 237 nt0.67□□□□□ -2.3
RPC25P35718 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.67□□□□□ -2.3
RPC25P35718 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.67□□□□□ -2.3
RPC25P35718 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.67□□□□□ -2.3
RPC25P35718 PMP1YCR024C-A 123 nt0.66□□□□□ -2.3
RPC25P35718 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.66□□□□□ -2.3
RPC25P35718 YLR456WYLR456W 615 nt0.66□□□□□ -2.3
RPC25P35718 YPL185WYPL185W 396 nt0.66□□□□□ -2.3
RPC25P35718 YBR064WYBR064W 429 nt0.66□□□□□ -2.3
RPC25P35718 PTP2YOR208W 2253 nt0.65□□□□□ -2.31
RPC25P35718 NOP9YJL010C 2001 nt0.65□□□□□ -2.31
RPC25P35718 YDR344CYDR344C 444 nt0.64□□□□□ -2.31
RPC25P35718 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.64□□□□□ -2.31
RPC25P35718 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.64□□□□□ -2.31
RPC25P35718 RPS30BYOR182C 192 nt0.64□□□□□ -2.31
RPC25P35718 YBR206WYBR206W 324 nt0.64□□□□□ -2.31
RPC25P35718 YCK3YER123W 1575 nt0.64□□□□□ -2.31
RPC25P35718 YKL063CYKL063C 504 nt0.63□□□□□ -2.31
RPC25P35718 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.63□□□□□ -2.31
RPC25P35718 ECM12YHR021W-A 456 nt0.62□□□□□ -2.31
RPC25P35718 YLR434CYLR434C 384 nt0.62□□□□□ -2.31
RPC25P35718 YPL044CYPL044C 549 nt0.62□□□□□ -2.31
RPC25P35718 YOR029WYOR029W 336 nt0.61□□□□□ -2.31
RPC25P35718 OLI1Q0130 231 nt0.6□□□□□ -2.31
RPC25P35718 STF2YGR008C 255 nt0.6□□□□□ -2.31
RPC25P35718 HUG1YML058W-A 207 nt0.6□□□□□ -2.31
RPC25P35718 MCM10YIL150C 1716 nt0.6□□□□□ -2.31
RPC25P35718 UTP10YJL109C 5310 nt0.6□□□□□ -2.31
RPC25P35718 CHS6YJL099W 2241 nt0.59□□□□□ -2.31
RPC25P35718 YDR426CYDR426C 378 nt0.59□□□□□ -2.31
RPC25P35718 YPL205CYPL205C 345 nt0.59□□□□□ -2.31
RPC25P35718 Q0017Q0017 162 nt0.58□□□□□ -2.32
RPC25P35718 NPR2YEL062W 1848 nt0.58□□□□□ -2.32
RPC25P35718 LTE1YAL024C 4308 nt0.57□□□□□ -2.32
RPC25P35718 PCC1YKR095W-A 267 nt0.57□□□□□ -2.32
RPC25P35718 YOR218CYOR218C 420 nt0.57□□□□□ -2.32
RPC25P35718 BSC3YLR465C 309 nt0.55□□□□□ -2.32
RPC25P35718 YMR160WYMR160W 2451 nt0.53□□□□□ -2.32
RPC25P35718 PAA1YDR071C 576 nt0.53□□□□□ -2.32
RPC25P35718 VPS20YMR077C 666 nt0.53□□□□□ -2.32
RPC25P35718 YOR053WYOR053W 342 nt0.53□□□□□ -2.32
RPC25P35718 ASE1YOR058C 2658 nt0.53□□□□□ -2.32
RPC25P35718 SPO21YOL091W 1830 nt0.52□□□□□ -2.33
RPC25P35718 YML002WYML002W 2214 nt0.52□□□□□ -2.33
RPC25P35718 YLR202CYLR202C 327 nt0.52□□□□□ -2.33
RPC25P35718 PRM3YPL192C 402 nt0.52□□□□□ -2.33
RPC25P35718 HMRA2YCR096C 360 nt0.51□□□□□ -2.33
RPC25P35718 YPL068CYPL068C 882 nt0.51□□□□□ -2.33
RPC25P35718 UBP3YER151C 2739 nt0.5□□□□□ -2.33
RPC25P35718 YER079WYER079W 633 nt0.49□□□□□ -2.33
RPC25P35718 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.49□□□□□ -2.33
RPC25P35718 RPL26BYGR034W 384 nt0.49□□□□□ -2.33
RPC25P35718 YLR334CYLR334C 381 nt0.49□□□□□ -2.33
RPC25P35718 YNL324WYNL324W 396 nt0.49□□□□□ -2.33
RPC25P35718 FYV10YIL097W 1551 nt0.49□□□□□ -2.33
RPC25P35718 YNL211CYNL211C 261 nt0.48□□□□□ -2.33
RPC25P35718 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.48□□□□□ -2.33
RPC25P35718 CSN9YDR179C 489 nt0.47□□□□□ -2.33
RPC25P35718 AGA2YGL032C 264 nt0.47□□□□□ -2.33
RPC25P35718 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.47□□□□□ -2.33
RPC25P35718 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.47□□□□□ -2.33
RPC25P35718 YBR285WYBR285W 435 nt0.47□□□□□ -2.33
RPC25P35718 YSP1YHR155W 3687 nt0.46□□□□□ -2.34
RPC25P35718 YJL120WYJL120W 324 nt0.44□□□□□ -2.34
RPC25P35718 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.44□□□□□ -2.34
RPC25P35718 RPS25BYLR333C 327 nt0.44□□□□□ -2.34
RPC25P35718 YPL225WYPL225W 441 nt0.44□□□□□ -2.34
RPC25P35718 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.43□□□□□ -2.34
RPC25P35718 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.43□□□□□ -2.34
RPC25P35718 YJR157WYJR157W 363 nt0.43□□□□□ -2.34
RPC25P35718 YOR121CYOR121C 306 nt0.43□□□□□ -2.34
RPC25P35718 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.43□□□□□ -2.34
RPC25P35718 SEC8YPR055W 3198 nt0.43□□□□□ -2.34
RPC25P35718 BEM3YPL115C 3387 nt0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.8 ms