Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Irx6Q9ER75 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx6Q9ER75 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms