Protein–RNA interactions for Protein: Q12405

LPX1, Peroxisomal membrane protein LPX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LPX1Q12405 GCV2YMR189W 3105 nt2.52□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 MMS1YPR164W 4224 nt2.52□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YER138CYER138C 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YER160CYER160C 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YJR027WYJR027W 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YML039WYML039W 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YML045WYML045W 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YMR050CYMR050C 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 RGA2YDR379W 3030 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 PAU8YAL068C 363 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 PAU18YLL064C 363 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 PAU6YNR076W 363 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 PAU20YOL161C 363 nt2.51□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 SET2YJL168C 2202 nt2.5□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 CTF4YPR135W 2784 nt2.5□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 ZRG8YER033C 3231 nt2.5□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 ZRG17YNR039C 1818 nt2.5□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 ACB1YGR037C 264 nt2.5□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YLR282CYLR282C 342 nt2.5□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 SMY2YBR172C 2223 nt2.5□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 SBE22YHR103W 2559 nt2.5□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 IRR1YIL026C 3453 nt2.49□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.49□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.49□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.49□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YNL211CYNL211C 261 nt2.49□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 CRS5YOR031W 210 nt2.49□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 CAF120YNL278W 3183 nt2.49□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 SCP160YJL080C 3669 nt2.48□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 FIR1YER032W 2631 nt2.48□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 APL5YPL195W 2799 nt2.48□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt2.48□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YOR055WYOR055W 435 nt2.48□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.48□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YCL046WYCL046W 324 nt2.48□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 SGS1YMR190C 4344 nt2.47□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 SDC25YLL016W 3147 nt2.47□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 CYR1YJL005W 6081 nt2.47□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 ZIP2YGL249W 2115 nt2.47□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 ESL2YKR096W 3588 nt2.47□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 OST4YDL232W 111 nt2.47□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt2.47□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt2.47□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.47□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 CDC31YOR257W 486 nt2.47□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 YFR016CYFR016C 3702 nt2.47□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 MGM1YOR211C 2646 nt2.47□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 RAD34YDR314C 2079 nt2.46□□□□□ -2.01
LPX1Q12405 SLD3YGL113W 2007 nt2.46□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 RPL31AYDL075W 342 nt2.46□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 PDR11YIL013C 4236 nt2.46□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 NUM1YDR150W 8247 nt2.46□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 PHO91YNR013C 2685 nt2.45□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 NOC3YLR002C 1992 nt2.45□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 TOR1YJR066W 7413 nt2.45□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.45□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 ESC1YMR219W 4977 nt2.44□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 SAS3YBL052C 2496 nt2.44□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 MSB1YOR188W 3414 nt2.44□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 INP53YOR109W 3324 nt2.43□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.43□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 SOM1YEL059C-A 225 nt2.43□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.43□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 YBR206WYBR206W 324 nt2.43□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 ARP8YOR141C 2646 nt2.43□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 BNR1YIL159W 4128 nt2.43□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 CAT2YML042W 2013 nt2.42□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 UBP15YMR304W 3693 nt2.42□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 RPS30BYOR182C 192 nt2.42□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 NAM7YMR080C 2916 nt2.42□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 ZIP1YDR285W 2628 nt2.42□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 YOR019WYOR019W 2193 nt2.42□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 DCP2YNL118C 2913 nt2.41□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 SRO77YBL106C 3033 nt2.41□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.41□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 STE11YLR362W 2154 nt2.41□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 MAD1YGL086W 2250 nt2.4□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 CDC53YDL132W 2448 nt2.4□□□□□ -2.02
LPX1Q12405 SMC6YLR383W 3345 nt2.4□□□□□ -2.03
LPX1Q12405 DGR2YKL121W 2559 nt2.4□□□□□ -2.03
LPX1Q12405 YDR239CYDR239C 2364 nt2.39□□□□□ -2.03
LPX1Q12405 HOS4YIL112W 3252 nt2.39□□□□□ -2.03
LPX1Q12405 NOP14YDL148C 2433 nt2.39□□□□□ -2.03
LPX1Q12405 PTP2YOR208W 2253 nt2.38□□□□□ -2.03
LPX1Q12405 MET6YER091C 2304 nt2.38□□□□□ -2.03
LPX1Q12405 YDL118WYDL118W 381 nt2.37□□□□□ -2.03
LPX1Q12405 PRP5YBR237W 2550 nt2.37□□□□□ -2.03
LPX1Q12405 INP51YIL002C 2841 nt2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.9 ms