Protein–RNA interactions for Protein: Q04201

CUE4, CUE domain-containing protein CUE4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE4Q04201 COG4YPR105C 2586 nt0.54□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 RIM20YOR275C 1986 nt0.54□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 WIP1YDR374W-A 270 nt0.54□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 YDR521WYDR521W 336 nt0.54□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 GEA2YEL022W 4380 nt0.54□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 WAR1YML076C 2835 nt0.54□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 STE18YJR086W 333 nt0.53□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 PBI2YNL015W 228 nt0.53□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 ZIP2YGL249W 2115 nt0.53□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 YAR009CYAR009C 3591 nt0.52□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 EMC4YGL231C 573 nt0.52□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 YJL135WYJL135W 318 nt0.52□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 EAF6YJR082C 342 nt0.52□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 CDC33YOL139C 642 nt0.52□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 EFR3YMR212C 2349 nt0.52□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 PRP16YKR086W 3216 nt0.51□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.51□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 ALG13YGL047W 609 nt0.51□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 CMC4YMR194C-B 222 nt0.51□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 YPL182CYPL182C 384 nt0.51□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 BFR2YDR299W 1605 nt0.5□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 LTE1YAL024C 4308 nt0.5□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 YNR025CYNR025C 360 nt0.5□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 LOA1YPR139C 903 nt0.5□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 CLU1YMR012W 3834 nt0.5□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 snR72snR72 98 nt0.49□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 TIM13YGR181W 318 nt0.49□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 AIM29YKR074W 468 nt0.49□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 YML108WYML108W 318 nt0.49□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 IES4YOR189W 351 nt0.49□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.49□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 UTP10YJL109C 5310 nt0.49□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 DBP6YNR038W 1890 nt0.48□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 YML002WYML002W 2214 nt0.48□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 RPS27AYKL156W 249 nt0.48□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 YML003WYML003W 873 nt0.48□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 YHL042WYHL042W 453 nt0.47□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.47□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 YOL160WYOL160W 342 nt0.47□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 RPB10YOR210W 213 nt0.47□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.47□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 UBP3YER151C 2739 nt0.47□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 PAC1YOR269W 1485 nt0.47□□□□□ -2.33
CUE4Q04201 PAN2YGL094C 3348 nt0.46□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 ISD11YER048W-A 285 nt0.46□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 GPG1YGL121C 381 nt0.46□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 YKL202WYKL202W 582 nt0.46□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 YBL071CYBL071C 309 nt0.46□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.46□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.46□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 YHR125WYHR125W 306 nt0.45□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.45□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 ZEO1YOL109W 342 nt0.45□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 PKH2YOL100W 3246 nt0.45□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 YDL011CYDL011C 324 nt0.44□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.44□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 snR51snR51 107 nt0.44□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 RAD34YDR314C 2079 nt0.44□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 YDR344CYDR344C 444 nt0.43□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 ECM12YHR021W-A 456 nt0.43□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 TMA10YLR327C 261 nt0.43□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.43□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 YPL261CYPL261C 309 nt0.43□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 NOP9YJL010C 2001 nt0.42□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 TTI1YKL033W 3117 nt0.42□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 PMP1YCR024C-A 123 nt0.42□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 SDH7YDR511W 402 nt0.42□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 RTT102YGR275W 474 nt0.42□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 YHL041WYHL041W 450 nt0.42□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.42□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 CHS6YJL099W 2241 nt0.41□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 YLR287CYLR287C 1068 nt0.41□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 RPL38YLR325C 237 nt0.41□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt0.41□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 YBR064WYBR064W 429 nt0.41□□□□□ -2.34
CUE4Q04201 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.4□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 YGR290WYGR290W 444 nt0.4□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 FYV7YLR068W 456 nt0.4□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt0.4□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 BI2Q0110 1272 nt0.39□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 YHR130CYHR130C 336 nt0.39□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 UBC7YMR022W 498 nt0.39□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 YBL108WYBL108W 306 nt0.39□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 YOR282WYOR282W 321 nt0.39□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 YCK3YER123W 1575 nt0.39□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 NPR2YEL062W 1848 nt0.38□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 CBS1YDL069C 690 nt0.38□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 YNL122CYNL122C 348 nt0.38□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 MCM10YIL150C 1716 nt0.38□□□□□ -2.35
CUE4Q04201 DIE2YGR227W 1578 nt0.37□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.8 ms