Protein–RNA interactions for Protein: P53225

YGR039W, Uncharacterized protein YGR039W, yeast

Predictions only

Length 103 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGR039W	P53225	YGR290W	YGR290W	444 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	YLR217W	YLR217W	324 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	CDC33	YOL139C	642 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	BUD26	YDR241W	288 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	YJR079W	YJR079W	330 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	YLR271W	YLR271W	825 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	YLR412C-A	YLR412C-A	207 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	MLP2	YIL149C	5040 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	YDR250C	YDR250C	276 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	YGL015C	YGL015C	393 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	SDS22	YKL193C	1017 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	ZIP2	YGL249W	2115 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	RCN2	YOR220W	798 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	YPL044C	YPL044C	549 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	YPR096C	YPR096C	303 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	SEC8	YPR055W	3198 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	CWC23	YGL128C	852 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	YBL062W	YBL062W	381 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	YOR053W	YOR053W	342 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
YGR039W	P53225	YKL145W-A	YKL145W-A	93 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	VAM3	YOR106W	852 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	snR13	snR13	124 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	YBL100W-B	YBL100W-B	5313 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	AI1	Q0050	2505 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	YOR029W	YOR029W	336 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	YOR248W	YOR248W	303 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	YOR192C-B	YOR192C-B	5313 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	PKH2	YOL100W	3246 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	YDR269C	YDR269C	324 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	PRP5	YBR237W	2550 nt		-0.12	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	INP2	YMR163C	2118 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	BIR1	YJR089W	2865 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	YJL135W	YJL135W	318 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	snR5	snR5	204 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	YGR228W	YGR228W	345 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	YMR290W-A	YMR290W-A	348 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	snR190	snR190	190 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	PRP42	YDR235W	1635 nt		-0.16	□□□□□ -2.43
YGR039W	P53225	RCO1	YMR075W	2055 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	YIR018C-A	YIR018C-A	138 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	COG8	YML071C	1824 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	MCM10	YIL150C	1716 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	YLR232W	YLR232W	348 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	YNL050C	YNL050C	813 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	YBL107W-A	YBL107W-A	105 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	YCL002C	YCL002C	792 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	MRPL50	YNR022C	420 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	YBR064W	YBR064W	429 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	IRC16	YPR038W	360 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	CUL3	YGR003W	2235 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	ASE1	YOR058C	2658 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	RPL35A	YDL191W	363 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	RPS27A	YKL156W	249 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	ORC3	YLL004W	1851 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	YLR198C	YLR198C	360 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	SSS1	YDR086C	243 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	OLI1	Q0130	231 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	PHS1	YJL097W	654 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	PRP21	YJL203W	843 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	YMR141W-A	YMR141W-A	225 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	RPS30B	YOR182C	192 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	YPL185W	YPL185W	396 nt		-0.21	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	OST4	YDL232W	111 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	RPB10	YOR210W	213 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	YBR076C-A	YBR076C-A	267 nt		-0.22	□□□□□ -2.44
YGR039W	P53225	YDR029W	YDR029W	315 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	WIP1	YDR374W-A	270 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	ULI1	YFR026C	510 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	YGR115C	YGR115C	780 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	POP7	YBR167C	423 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	YGL239C	YGL239C	315 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	YPR160W-A	YPR160W-A	81 nt		-0.24	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	EFR3	YMR212C	2349 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	YDR371C-A	YDR371C-A	105 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	YFR012W-A	YFR012W-A	87 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	COX5B	YIL111W	456 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	ILM1	YJR118C	612 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	YBR063C	YBR063C	1215 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	YPR039W	YPR039W	336 nt		-0.25	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	HAL9	YOL089C	3093 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	MRPL32	YCR003W	552 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	SPO13	YHR014W	876 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	APQ13	YJL075C	417 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	YBL008W-A	YBL008W-A	240 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	YOL160W	YOL160W	342 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	RAD34	YDR314C	2079 nt		-0.26	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	YPL261C	YPL261C	309 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	snR45	snR45	172 nt		-0.27	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	YAP6	YDR259C	1152 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	AFB1	YLR040C	675 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	YPT6	YLR262C	648 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	LEE1	YPL054W	906 nt		-0.28	□□□□□ -2.45
YGR039W	P53225	STE5	YDR103W	2754 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
YGR039W	P53225	RPS26A	YGL189C	360 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
YGR039W	P53225	YIR021W-A	YIR021W-A	213 nt		-0.29	□□□□□ -2.46
YGR039W	P53225	SCEI	Q0160	708 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
YGR039W	P53225	YAL067W-A	YAL067W-A	228 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
YGR039W	P53225	YMR254C	YMR254C	309 nt		-0.3	□□□□□ -2.46
YGR039W	P53225	snR9	snR9	187 nt		-0.31	□□□□□ -2.46

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