Protein–RNA interactions for Protein: P38729

YHL042W, Putative uncharacterized protein YHL042W, yeastyeast

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL042WP38729 SEC1YDR164C 2175 nt0.53□□□□□ -2.32
YHL042WP38729 snR72snR72 98 nt0.52□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 WIP1YDR374W-A 270 nt0.52□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 AIM29YKR074W 468 nt0.52□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 YML003WYML003W 873 nt0.52□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.52□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 RPB10YOR210W 213 nt0.52□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 WAR1YML076C 2835 nt0.52□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 YJR003CYJR003C 1560 nt0.52□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 SLI15YBR156C 2097 nt0.52□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 EFR3YMR212C 2349 nt0.52□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 PRE4YFR050C 801 nt0.51□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 BIG1YHR101C 1008 nt0.51□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 STE18YJR086W 333 nt0.51□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 IES4YOR189W 351 nt0.51□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 PDE2YOR360C 1581 nt0.51□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 COG4YPR105C 2586 nt0.51□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 ZIP2YGL249W 2115 nt0.5□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 YJL135WYJL135W 318 nt0.5□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 RPS27AYKL156W 249 nt0.5□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 MMS4YBR098W 2076 nt0.5□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 YCS4YLR272C 3531 nt0.5□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 TIM13YGR181W 318 nt0.49□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 YOR199WYOR199W 330 nt0.49□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 IML1YJR138W 4755 nt0.48□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.48□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 YML108WYML108W 318 nt0.48□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 BFR2YDR299W 1605 nt0.47□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 YAR009CYAR009C 3591 nt0.47□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 NUP157YER105C 4176 nt0.47□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 YDR344CYDR344C 444 nt0.47□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 YHR125WYHR125W 306 nt0.47□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.47□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 YBL071CYBL071C 309 nt0.47□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 YPR153WYPR153W 423 nt0.47□□□□□ -2.33
YHL042WP38729 ALG13YGL047W 609 nt0.46□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 YGR290WYGR290W 444 nt0.46□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 YHL041WYHL041W 450 nt0.46□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 FYV7YLR068W 456 nt0.46□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 YML002WYML002W 2214 nt0.45□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 PKH2YOL100W 3246 nt0.45□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 DBP6YNR038W 1890 nt0.45□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 LTE1YAL024C 4308 nt0.44□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 NHP2YDL208W 471 nt0.44□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.44□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt0.44□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt0.44□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.44□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 YLR287CYLR287C 1068 nt0.44□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 ZEO1YOL109W 342 nt0.44□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 YPL182CYPL182C 384 nt0.44□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 YLL007CYLL007C 1998 nt0.43□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 GPG1YGL121C 381 nt0.43□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 TOM22YNL131W 459 nt0.43□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 snR41snR41 95 nt0.43□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 snR51snR51 107 nt0.43□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 TTI1YKL033W 3117 nt0.42□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 YKL083WYKL083W 615 nt0.42□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 YNL122CYNL122C 348 nt0.42□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 ALY2YJL084C 3141 nt0.42□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 YDL158CYDL158C 309 nt0.41□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 SDH7YDR511W 402 nt0.41□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 YDR521WYDR521W 336 nt0.41□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 RTT102YGR275W 474 nt0.41□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.41□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 RPL38YLR325C 237 nt0.41□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 RPL26AYLR344W 384 nt0.41□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 CMC4YMR194C-B 222 nt0.41□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 LOA1YPR139C 903 nt0.41□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 PAC1YOR269W 1485 nt0.41□□□□□ -2.34
YHL042WP38729 YDL011CYDL011C 324 nt0.4□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 CBS1YDL069C 690 nt0.4□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 BI2Q0110 1272 nt0.4□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YKL202WYKL202W 582 nt0.4□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YOL160WYOL160W 342 nt0.4□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.4□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YDL032WYDL032W 312 nt0.39□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YDL073WYDL073W 2955 nt0.39□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 ECM12YHR021W-A 456 nt0.39□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.39□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YBR064WYBR064W 429 nt0.39□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 MCM10YIL150C 1716 nt0.38□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 RAD34YDR314C 2079 nt0.38□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 PCF11YDR228C 1881 nt0.38□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 DIE2YGR227W 1578 nt0.38□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YAP6YDR259C 1152 nt0.38□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.38□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YHR130CYHR130C 336 nt0.38□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 NPR2YEL062W 1848 nt0.37□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 ISD11YER048W-A 285 nt0.37□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 ECL1YGR146C 636 nt0.37□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YAR047CYAR047C 321 nt0.37□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 UBC7YMR022W 498 nt0.37□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.37□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 CHS6YJL099W 2241 nt0.36□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 PAM16YJL104W 450 nt0.36□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YLR101CYLR101C 396 nt0.36□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YLR171WYLR171W 390 nt0.36□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 YPL229WYPL229W 621 nt0.36□□□□□ -2.35
YHL042WP38729 OLI1Q0130 231 nt0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.9 ms