Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD3Q9UJU5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms