Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2surpQ6NV83 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U2surpQ6NV83 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U2surpQ6NV83 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms