Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MitfQ08874 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MitfQ08874 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms