Protein–RNA interactions for Protein: P40317

SOK1, Protein SOK1, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK1P40317 FMP23YBR047W 528 nt0.75□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YPR099CYPR099C 357 nt0.75□□□□□ -2.29
SOK1P40317 SLM6YBR266C 453 nt0.75□□□□□ -2.29
SOK1P40317 HNT1YDL125C 477 nt0.74□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YGR265WYGR265W 411 nt0.74□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.74□□□□□ -2.29
SOK1P40317 RCN2YOR220W 798 nt0.74□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YPR039WYPR039W 336 nt0.74□□□□□ -2.29
SOK1P40317 NUP157YER105C 4176 nt0.73□□□□□ -2.29
SOK1P40317 SEC1YDR164C 2175 nt0.73□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.73□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YDR509WYDR509W 348 nt0.73□□□□□ -2.29
SOK1P40317 PAU2YEL049W 363 nt0.73□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YER135CYER135C 393 nt0.73□□□□□ -2.29
SOK1P40317 SVS1YPL163C 783 nt0.73□□□□□ -2.29
SOK1P40317 HDA3YPR179C 1968 nt0.73□□□□□ -2.29
SOK1P40317 PAN3YKL025C 2040 nt0.72□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.72□□□□□ -2.29
SOK1P40317 snR84snR84 550 nt0.72□□□□□ -2.29
SOK1P40317 HUR1YGL168W 333 nt0.72□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.72□□□□□ -2.29
SOK1P40317 ILM1YJR118C 612 nt0.72□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.72□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.72□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YBR032WYBR032W 303 nt0.72□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YPR117WYPR117W 7470 nt0.72□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YDL073WYDL073W 2955 nt0.72□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YAP3YHL009C 993 nt0.71□□□□□ -2.3
SOK1P40317 NBL1YHR199C-A 222 nt0.71□□□□□ -2.3
SOK1P40317 YBL073WYBL073W 312 nt0.71□□□□□ -2.3
SOK1P40317 YOR248WYOR248W 303 nt0.71□□□□□ -2.3
SOK1P40317 YOP1YPR028W 543 nt0.71□□□□□ -2.3
SOK1P40317 SWI5YDR146C 2130 nt0.71□□□□□ -2.3
SOK1P40317 OST1YJL002C 1431 nt0.71□□□□□ -2.3
SOK1P40317 GDS1YOR355W 1569 nt0.7□□□□□ -2.3
SOK1P40317 YDR008CYDR008C 351 nt0.7□□□□□ -2.3
SOK1P40317 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.7□□□□□ -2.3
SOK1P40317 APL3YBL037W 3078 nt0.7□□□□□ -2.3
SOK1P40317 NHP2YDL208W 471 nt0.69□□□□□ -2.3
SOK1P40317 YGR025WYGR025W 303 nt0.69□□□□□ -2.3
SOK1P40317 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.69□□□□□ -2.3
SOK1P40317 SGO1YOR073W 1773 nt0.69□□□□□ -2.3
SOK1P40317 APQ13YJL075C 417 nt0.68□□□□□ -2.3
SOK1P40317 YJR003CYJR003C 1560 nt0.68□□□□□ -2.3
SOK1P40317 MKT1YNL085W 2493 nt0.67□□□□□ -2.3
SOK1P40317 MET32YDR253C 576 nt0.67□□□□□ -2.3
SOK1P40317 RPL32YBL092W 393 nt0.67□□□□□ -2.3
SOK1P40317 YLL054CYLL054C 2532 nt0.67□□□□□ -2.3
SOK1P40317 RKR1YMR247C 4689 nt0.67□□□□□ -2.3
SOK1P40317 SPO23YBR250W 1572 nt0.66□□□□□ -2.3
SOK1P40317 PXA2YKL188C 2562 nt0.66□□□□□ -2.3
SOK1P40317 YDR521WYDR521W 336 nt0.66□□□□□ -2.3
SOK1P40317 RPL9AYGL147C 576 nt0.66□□□□□ -2.3
SOK1P40317 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.66□□□□□ -2.3
SOK1P40317 CMC4YMR194C-B 222 nt0.66□□□□□ -2.3
SOK1P40317 GPI15YNL038W 690 nt0.66□□□□□ -2.3
SOK1P40317 YNR025CYNR025C 360 nt0.66□□□□□ -2.3
SOK1P40317 snR13snR13 124 nt0.66□□□□□ -2.3
SOK1P40317 YBR071WYBR071W 636 nt0.66□□□□□ -2.3
SOK1P40317 TOF2YKR010C 2316 nt0.66□□□□□ -2.3
SOK1P40317 LYS14YDR034C 2373 nt0.65□□□□□ -2.3
SOK1P40317 NUT1YGL151W 3399 nt0.65□□□□□ -2.3
SOK1P40317 SPT21YMR179W 2277 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 EMC4YGL231C 573 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 RPL16AYIL133C 600 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 HIT1YJR055W 495 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 STE18YJR086W 333 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 RPL9BYNL067W 576 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 NUT2YPR168W 474 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 PIG1YLR273C 1947 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 YMR160WYMR160W 2451 nt0.65□□□□□ -2.31
SOK1P40317 ENV11YGR071C 2583 nt0.64□□□□□ -2.31
SOK1P40317 ZIP1YDR285W 2628 nt0.64□□□□□ -2.31
SOK1P40317 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.64□□□□□ -2.31
SOK1P40317 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.64□□□□□ -2.31
SOK1P40317 RPF1YHR088W 888 nt0.64□□□□□ -2.31
SOK1P40317 SDH2YLL041C 801 nt0.64□□□□□ -2.31
SOK1P40317 YLR269CYLR269C 351 nt0.64□□□□□ -2.31
SOK1P40317 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.64□□□□□ -2.31
SOK1P40317 RUF22RUF22 515 nt0.64□□□□□ -2.31
SOK1P40317 TSC3YBR058C-A 243 nt0.64□□□□□ -2.31
SOK1P40317 SLD3YGL113W 2007 nt0.64□□□□□ -2.31
SOK1P40317 UTP20YBL004W 7482 nt0.63□□□□□ -2.31
SOK1P40317 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.63□□□□□ -2.31
SOK1P40317 AIM9YER080W 1884 nt0.63□□□□□ -2.31
SOK1P40317 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.63□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.63□□□□□ -2.31
SOK1P40317 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.63□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 78.8 ms