Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpv2Q9WTR1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpv2Q9WTR1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms