Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tspan11Q9D1D1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan11Q9D1D1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms